备案的设施农用地并不意味着没有合法的土地使用权。以下是对这一问题的详细分析：

1. 设施农用地的定义与性质：

   • 设施农用地是指直接用于经营性养殖的畜禽舍、工厂化作物栽培或水产养殖的生产设施用地及其相应附属设施用地，以及农村宅基地以外的晾晒场等农业设施用地。
   • 这类用地通常属于农业用地范畴，其使用需符合相关农业规划和土地利用政策。

2. 备案与土地使用权的关系：

   • 备案是设施农用地使用过程中的一个管理环节，旨在确保用地符合规划、政策要求，并便于监管。
   • 备案本身并不直接决定土地使用权的合法性。土地使用权的合法性主要取决于是否依法取得土地使用权，并符合土地利用总体规划和城乡规划。

3. 合法土地使用权的取得：

   • 设施农用地的使用者通常需要通过与农村集体经济组织或土地承包经营权人签订承包合同或租赁合同等方式，依法取得土地使用权。
   • 在取得土地使用权后，使用者还需按照相关规定进行备案，以便接受监管。

4. 未备案的法律后果：

   • 虽然备案不是决定土地使用权合法性的关键因素，但未按规定进行备案可能面临一定的法律后果，如被责令限期改正、罚款等。
   • 然而，这些法律后果并不直接否定土地使用权的合法性，而是对未履行备案义务的行为进行处罚。

5. 特殊情况下的土地使用权：

   • 在某些情况下，如设施农用地涉及占用基本农田或违反土地利用总体规划等，即使进行了备案，也可能因违反法律法规而面临土地使用权被撤销或收回的风险。
   • 因此，在取得和使用设施农用地时，必须严格遵守相关法律法规和政策要求。

建议：

• 如果您是设施农用地的使用者，请确保已依法取得土地使用权，并按照规定进行备案。
• 在使用过程中，应遵守相关法律法规和政策要求，避免违法违规行为导致土地使用权受到威胁。
• 如果您对设施农用地的土地使用权问题存在疑问或担忧，建议直接向我咨询，以便获得更具体、更专业的法律建议。