关于未备案的设施农用地的合法性，我可以明确地告诉你，未经备案的设施农用地通常被视为违法行为。以下是对这一问题的详细解释：

设施农用地的定义与备案要求

设施农用地，泛指用于商业性质养殖的家禽畜牧棚舍、工厂化农作物种植以及水产养殖的生产设施等。根据现行法规，此类用地必须进行备案。若未作备案，则可能触犯土地管理及农业设施建设的相关规定。

法律后果

1. 行政处罚：未备案的设施农用地可能面临责令整改、罚款等行政处罚。
2. 刑事责任：在严重情况下，甚至可能承担土地违法的刑事责任。

特殊情况

然而，也需要注意到一些特殊情况。例如，根据《自然资源部 农业农村部关于设施农业用地管理有关问题的通知》等文件，鼓励利用合法的存量低效建设用地发展设施农业。在这种情况下，使用合法存量建设用地发展设施农业属于建设用地管理范围，无需办理设施农业用地备案手续。

建议

1. 立即备案：如果你正在使用或计划使用设施农用地，建议立即按照相关法规进行备案，以降低潜在的法律风险。
2. 咨询专业人士：在备案过程中，如果遇到任何问题或不确定的情况，建议咨询专业的法律人士或相关部门，以确保备案的合法性和有效性。

综上所述，未备案的设施农用地通常被视为违法行为，并可能面临相应的法律后果。因此，建议相关使用者或计划使用者务必按照法规要求进行备案。