结论：政府因农户建房无不动产证而不给办理供电手续的行为，其合法性需分情况讨论，不能一概而论。
分析如下：
从行政许可与合法性证明的角度：
- 政府在办理供电手续时，通常要求农户提供一系列合法性证明文件，以确保供电设施的安全与合规使用。不动产证作为房屋合法性的重要证明，是政府审核过程中的关键文件之一。
- 若相关法律法规或地方政策明确规定，办理供电手续必须提供不动产证或其他等效的合法性证明，且农户确实未能提供，则政府拒绝办理供电手续的行为在形式上具有合法性。但这一合法性前提是相关规定的存在与合理性。
从行政行为合理性与比例原则的角度：
- 行政行为不仅应合法，还应合理，符合比例原则。即政府在行使权力时，应选择对公民权益影响最小的方式，且手段与目的之间应保持适当比例。
- 若农户因历史遗留问题、政策变动等特殊原因未能及时办理不动产证，但房屋本身合法且符合供电条件，政府直接拒绝办理供电手续可能构成行政行为的不合理。此时，政府应考虑采取其他措施，如要求农户提供其他合法性证明或承诺在一定期限内补办不动产证等，以平衡公共利益与公民权益。
从具体法律法规与地方政策的角度：
- 不同地区、不同时间段的法律法规与地方政策可能存在差异，对办理供电手续所需证明文件的要求也可能不同。
- 因此，要准确判断政府行为的合法性，还需查阅具体的法律法规与地方政策，了解当地对办理供电手续的具体要求与流程。
法律建议：
- 对于农户：若因无不动产证而被拒绝办理供电手续，首先应了解当地的具体法律法规与政策要求，确认是否确实需要提供不动产证。若确实需要，且因特殊原因未能及时办理，可尝试与政府沟通，提供其他合法性证明或承诺补办不动产证，以争取办理供电手续。
- 对于政府：在办理供电手续时，应充分考虑农户的实际情况与合理需求，遵循行政行为的合法性与合理性原则，避免一刀切地拒绝办理。对于因特殊原因未能及时办理不动产证的农户，可采取灵活措施，如要求提供其他证明文件或承诺补办等，以平衡公共利益与公民权益。
可能后果：
- 若政府行为合法且合理，农户未能提供不动产证或其他合法性证明，则政府拒绝办理供电手续的行为可能得到法律支持，农户需承担因无法供电而带来的不便与损失。
- 若政府行为存在不合理或违法之处，农户可通过行政复议或行政诉讼等途径维护自身权益，要求政府重新审核并办理供电手续。