结论：政府合作招商项目是否需要开具专用发票以及是否合法，需根据具体交易性质、主体资格及合同约定综合判断，以下分情况说明：

1. 若项目涉及增值税应税行为且交易方为一般纳税人
   根据《增值税暂行条例》及实施细则，若政府合作招商项目中存在销售货物、提供加工修理修配劳务、销售服务（如技术服务、咨询服务等）等增值税应税行为，且交易方为增值税一般纳税人，开具增值税专用发票是合法且必要的。专用发票可用于抵扣进项税额，降低企业税负，同时符合税务合规要求。
   例外情形：若交易方为小规模纳税人或非增值税纳税人（如政府机关本身），则无需开具专用发票，可开具普通发票或收据。

2. 若项目属于非增值税应税范围或符合免税条件
   若项目内容属于《增值税暂行条例》规定的免税项目（如直接用于科学研究、科学试验和教学的进口仪器、设备，或符合条件的政府性基金等），或交易本身不涉及增值税应税行为（如政府无偿划拨土地、资金补贴等），则无需开具专用发票，且开具专用发票可能违反税务规定。
   注意：需严格区分“免税”与“不征税”情形，后者如政府购买服务中的非经营性活动，可能直接不涉及增值税。

3. 合同约定与实际交易需一致
   即使项目符合开具专用发票的条件，合同中必须明确约定发票类型、税率及开具时间。若合同未约定或约定模糊，可能引发税务争议。例如，若合同约定“开具合法有效发票”，但未明确为专用发票，交易方可能仅需提供普通发票。
   风险提示：若实际交易与合同约定不符（如合同约定开具专用发票但实际开具普通发票），可能构成违约或税务违规。

4. 政府主体资格的特殊性
   若政府方作为购买方，需确认其是否具备抵扣进项税额的资格。根据《增值税暂行条例》，政府机关、事业单位等非企业性单位通常无法抵扣进项税额，因此即使交易方为一般纳税人，也可能无需开具专用发票。但若政府方通过下属企业或平台公司参与项目，且该企业具备一般纳税人资格，则需按企业间交易规则处理。

操作建议：

• 交易前明确项目性质、交易方资格及税务处理方式，必要时咨询税务机关；
  
• 在合同中详细约定发票类型、税率及违约责任，避免歧义；
  
• 保留交易凭证、合同及发票等资料，以备税务检查或争议解决。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体场景下的税务合规问题。