关于“肇事运营车辆停运费”的问题，以下是我的详细解答：
结论：肇事运营车辆的停运费，一般由侵权行为人承担。若保险公司对停运损失费免赔条款已尽到免责条款提示和说明义务的，则由实际侵权人进行赔偿。
分析说明：
停运损失的定义：
- 停运损失费是指在道路交通事故中，依法从事货物运输或者旅客运输经营活动等经营性活动的车辆，因交通事故无法进行正常的货物运输或者旅客运输经营而造成经济收入的减少或日常停运损失。
主张停运损失的主体：
- 依法从事货物运输、旅客运输等经营性活动的车辆，如出租汽车、预约出租汽车（网约车）、营运大货车等，其登记所有人可以主张停运损失。
停运损失的承担者：
- 行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任，故停运损失一般由侵权行为人承担。
- 停运损失属于可得利益损失，不属于因交通事故所产生的直接损失，而是间接财产损失，不计入交强险赔付范围。
- 对于商业第三者责任险是否理赔，应以具体条款为准。若保险公司对停运损失费免赔条款已尽到免责条款提示和说明义务的，保险公司在商业第三者责任险范围内免赔，停运损失由实际侵权人进行赔偿。
处理建议：
- 停运损失通常标的额不大，建议尽量通过调解方式处理。
- 若调解不成需要起诉的，应当如实陈述及举证，包括提供车辆运营记录、收入证明等证据，以支持自己的主张。
举例说明：
假设一辆出租车与一辆小轿车发生碰撞，造成出租车受损无法运营。经交警部门认定，小轿车驾驶员承担事故主要责任。出租车修理期间产生了停运损失，出租车公司可以将小轿车驾驶员诉至法院，要求赔偿停运损失。若小轿车驾驶员的保险公司对停运损失费免赔条款已尽到免责条款提示和说明义务的，则停运损失由小轿车驾驶员承担。
综上所述，肇事运营车辆的停运费由侵权行为人承担，但需注意保险公司对停运损失费的赔付情况，并根据具体情况选择适当的处理方式。如有进一步问题，请直接向我咨询。