营运车辆的停运损失，主要由事故责任方承担，具体责任分配需依据交强险、商业三者险的保险条款以及相关法律规定来确定。以下是对该问题的详细分析：
一、保险公司赔偿情形
交强险：
- 赔偿依据：虽然交强险主要目的是保障受害人得到及时有效赔偿，且条款中未明确将间接损失（如停运损失）纳入赔偿范围，但根据《最高人民法院关于审理道路交通事故损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》，合理的停运损失可被视为财产损失的一部分，部分法院在司法实践中会判决交强险在责任限额范围内对停运损失进行赔偿。
- 赔偿范围：交强险有责任财产损失赔偿限额为2000元，无责任财产损失赔偿限额为100元。符合规定的停运损失在此限额内可获得赔偿。
商业三者险：
- 一般情况：商业三者险合同条款常明确约定停运损失等间接损失为免赔范围。若保险公司已履行提示和明确说明义务，则不承担停运损失的赔偿责任。
- 未履行提示说明义务：若保险公司未能证明其已就免责条款向投保人履行提示和明确说明义务，则该免责条款无效，保险公司需在商业三者险责任限额内赔偿停运损失。
二、侵权人赔偿情形
- 保险公司免赔：当保险公司依据保险合同条款对停运损失免责时，侵权人作为直接责任方，应对营运车辆的合理停运损失承担赔偿责任。
- 超出保险限额：若停运损失超出交强险和商业三者险的赔偿限额，超出部分由侵权人承担。
- 双方都有责任：若交通事故双方均有责任，则停运损失应按各自的责任比例分担。例如，若一方承担70%的责任，则其需赔偿停运损失的70%。
三、特殊情形
- 雇员侵权：根据《中华人民共和国民法典》规定，若侵权人在执行工作任务过程中发生交通事故导致营运车辆受损并产生停运损失，由用人单位承担侵权责任。用人单位承担后，可向有故意或重大过失的工作人员追偿。
- 挂靠经营：以挂靠形式从事道路运输经营的机动车发生交通事故造成损害且属于该机动车一方责任的，挂靠人和被挂靠人应承担连带责任，共同赔偿营运车辆的停运损失。
四、赔偿计算与证据提供
在确定停运损失时，需考虑事故责任比例、受损车辆运营收入情况、维修时间等因素。受害者应提供相关证据和资料，如运营记录、收入证明、维修发票等，以准确计算和主张停运损失。例如，若一辆出租车因事故停运10天，日均营收为500元，扣除必要成本后日均净收入为400元，则停运损失为4000元（400元/天 × 10天）。
五、实际操作建议
- 在处理营运车辆停运损失问题时，建议首先明确责任主体，了解自身权益及赔偿途径。
- 与保险公司或侵权人协商时，应明确赔偿范围、金额及支付方式，并保留好相关证据和资料。
- 若协商无果，可及时通过诉讼或调解等方式维护自身权益，确保停运损失得到合理赔偿。
综上所述，营运车辆因事故导致的停运损失承担问题涉及多个法律知识点，需根据具体情况综合考虑。在处理此类问题时，应明确责任主体、赔偿依据及计算方法。如果你有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，可以直接向我咨询。