结论：仲裁能判定末位淘汰为违法行为，若公司直接以此为由解除与劳动者的劳动合同，且未遵循法定条件和程序，则很可能构成违法解雇。
详细分析：
末位淘汰制的法律性质与劳动合同解除的合法性：
- 末位淘汰制本身并不直接等同于法律规定的解除劳动合同的合法理由。根据《劳动合同法》等相关法律法规，劳动合同的解除必须基于法定情形，如劳动者严重违反用人单位规章制度、不能胜任工作且经培训或调岗后仍不能胜任等。
- 仅因劳动者在考核中处于末位，并不能直接证明其不能胜任工作。不能胜任工作需要有明确的界定标准，并且用人单位需要提供充分的证据来证明这一点。如果公司未能提供充分证据，仲裁机构很可能认定其解除劳动合同的行为违法。
劳动仲裁过程中双方的举证责任：
- 在劳动仲裁过程中，劳动者需要提供证明自己与公司存在劳动关系的证据，如劳动合同、工资流水、工作证等。同时，如果劳动者认为公司的解除行为违法，也需要提供相应的证据来支持自己的主张。
- 用人单位则需举证证明其解除劳动合同的合法性。例如，证明劳动者确实不能胜任工作，并且已经履行了相应的培训或调岗等法定程序。如果公司无法提供充分证据，仲裁机构将倾向于支持劳动者的主张。
违法解除劳动合同的法律后果：
- 如果仲裁机构认定公司违法解除劳动合同，公司可能需要承担相应的法律责任。根据《劳动合同法》的规定，违法解除劳动合同的，公司可能需要支付经济赔偿金，通常为经济补偿标准的二倍。经济补偿标准根据劳动者在公司的工作年限和月工资等因素确定。
对公司的合规建议：
- 公司在实行末位淘汰制或其他任何管理制度时，必须确保其行为符合法律法规的要求，尊重劳动者的合法权益。建议公司在制定相关制度时，咨询专业法律顾问，以确保制度的合法性和合规性。
- 如果公司确实需要解除与劳动者的劳动合同，必须确保解除行为基于合法、合理且明确的理由，并且遵循相应的法律程序。例如，对于不能胜任工作的劳动者，公司应先进行培训或调岗，如果仍然不能胜任，再考虑解除劳动合同。
举例说明：
假设某公司实行末位淘汰制，并以此为由解除了与劳动者小张的劳动合同。小张认为公司的解除行为违法，于是向当地的劳动争议仲裁委员会提起了劳动仲裁。在仲裁过程中，小张提供了劳动合同、工资流水等证据证明自己与公司存在劳动关系，并主张公司未能提供充分证据证明其不能胜任工作。而公司则未能提供充分证据来支持其解除行为的合法性。最终，仲裁机构认定公司的解除行为违法，并裁决公司支付小张经济赔偿金。
总结与建议：
仲裁机构能够判定末位淘汰为违法行为，如果公司直接以此为由解除劳动合同且未遵循法定条件和程序。因此，建议公司在实行末位淘汰制或其他管理制度时，务必确保行为的合法性和合规性，尊重劳动者的合法权益。如果劳动者认为自己的权益受到侵害，有权向劳动争议仲裁委员会提起劳动仲裁以维护自身权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。