结论前置：

1. 职务侵占民事判决后，仍可能被追究刑事责任。职务侵占罪属于公诉案件，民事判决不影响刑事责任的追究。
2. 民事协议在量刑时可能作为从轻处罚的情节。如果犯罪嫌疑人在案发后积极退赃退赔，并取得被害单位的谅解，可能在量刑时被考虑从轻处罚。

详细分析：

1. 职务侵占罪的性质与刑事责任：

   • 职务侵占罪是指公司、企业或其他单位的工作人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，且数额较大的行为。这是一种侵犯财产权的犯罪行为，明确受《中华人民共和国刑法》第二百七十一条的规制。
   • 由于职务侵占罪属于公诉案件，由人民检察院代表国家提起公诉，因此，即使被害单位与犯罪嫌疑人就职务侵占的财物返还、赔偿等事项达成了民事协议，这并不能免除犯罪嫌疑人的刑事责任。司法机关仍可依法追究其刑事责任。

2. 民事协议与刑事责任的关系：

   • 民事协议主要处理的是民事纠纷部分，如财物的返还、赔偿等。而刑事责任则是对犯罪行为的法律制裁，两者性质不同，不能相互替代。
   • 即使犯罪嫌疑人与被害单位达成了民事协议，并履行了协议内容，这只能表明其有一定的悔罪表现，但并不能完全免除其刑事责任。司法机关在追究刑事责任时，会综合考虑犯罪嫌疑人的犯罪情节、悔罪表现等因素。

3. 民事协议对量刑的影响：

   • 积极退赃退赔：如果犯罪嫌疑人在案发后积极退还侵占的财物，这通常被视为其有一定的悔罪表现。在量刑时，法院可能会将此作为从轻处罚的情节予以考量，可能酌情从轻判处刑罚，甚至在符合条件的情况下适用缓刑。
   • 取得谅解：被害单位出具的谅解书也是法院从轻量刑的因素之一。谅解书体现了双方的和解意愿及被告人的悔罪态度，有助于法院在量刑时给予一定的从宽处理。然而，谅解并不必然导致不追究刑事责任，只是在量刑幅度上可能有所体现。

4. 特殊情形的考量：

   • 如果存在犯罪情节显著轻微、危害不大等特殊情形，依据刑法的相关规定，可能不被认为是犯罪。例如，侵占财物数额刚达到立案标准，且犯罪嫌疑人在发现错误后及时主动归还财物，没有给单位造成实际损失，并取得了单位的谅解，这种情况下有可能被认定为情节显著轻微而不构成犯罪。但这种情况较为罕见，且需要严格的证据支持。

法律建议：

• 如果您或您身边的人涉及职务侵占罪，且已经达成了民事协议，建议尽快咨询专业律师（即我本人，张惠全律师），了解具体的法律后果和可能的辩护策略。
• 在面对司法机关的调查和审判时，应积极配合，如实供述自己的罪行，并展示悔罪态度，以争取从轻处罚的机会。

法律依据：

• 《中华人民共和国刑法》第二百七十一条：公司、企业或者其他单位的工作人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；数额巨大的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；数额特别巨大的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。