针对“有不起诉决定的，纪委可以直接立案吗”这一问题，首先明确结论：纪委对于有不起诉决定的案件，并不能直接立案。以下是对此结论的详细阐述：

1. 纪委的职权范围：

   • 纪委主要负责党的纪律检查工作，对党组织和党员进行监督，处理党内违纪案件。
   • 纪委的立案调查主要针对党内违纪行为，而非司法程序中的犯罪行为。

2. 不起诉决定的法律效力：

   • 不起诉决定是检察机关根据法律规定，对犯罪嫌疑人作出的不追究刑事责任的决定。
   • 一旦作出不起诉决定，除非有新的证据或情况，否则该决定具有法律效力，不得随意撤销或变更。

3. 纪委与司法机关的关系：

   • 纪委与司法机关在职责上有所区分，各自独立行使职权。
   • 纪委不能直接干预司法机关的诉讼活动，包括起诉、审判等。

4. 纪委立案的前提条件：

   • 纪委立案的前提是存在党内违纪行为，且该行为需要达到一定的严重程度。
   • 对于已经由司法机关处理并作出不起诉决定的案件，纪委通常不会再次立案调查，除非发现新的违纪事实或证据。

综上所述，纪委对于有不起诉决定的案件，并不能直接立案。如果纪委在调查过程中发现新的违纪事实或证据，可以依据党内规定进行立案调查，但这与司法机关的不起诉决定无直接关联。如有进一步疑问或需要法律帮助，请直接向我咨询。