结论：若合同约定公司代扣代缴增值税但没有实际缴纳，责任承担需分情况讨论，一般可能由公司承担主要责任，但在特定情形下，如合同有特别约定或存在其他过错方，责任承担可能会有所不同。以下为详细分析：

1. 合同约定与公司责任

   • 合同约定效力：合同是双方意思表示一致的产物，具有法律约束力。若合同中明确约定了公司代扣代缴增值税的义务，那么公司就应当按照约定履行这一义务。
   • 公司未缴纳的责任：如果公司没有按照合同约定实际缴纳增值税，那么公司就构成了违约。根据合同法的相关规定，违约方应当承担违约责任，包括但不限于继续履行、赔偿损失等。因此，在这种情况下，公司应当承担未缴纳增值税的责任，并可能需要向对方支付违约金或赔偿损失。

2. 税务法规与公司责任

   • 税务法规要求：根据税务法规，公司作为扣缴义务人，有义务按照法律规定代扣代缴增值税。如果公司未履行这一义务，税务机关有权对公司进行处罚，包括但不限于罚款、加收滞纳金等。
   • 税务责任与合同责任的重叠：虽然税务责任和合同责任是两种不同的责任形式，但在公司未代扣代缴增值税的情况下，这两种责任可能会重叠。公司既可能因违反合同约定而承担民事责任，也可能因违反税务法规而承担行政责任。

3. 特殊情况下的责任承担

   • 合同特别约定：如果合同中特别约定了在公司未代扣代缴增值税的情况下，责任由哪一方承担，或者约定了免责条款等，那么应当按照合同约定来处理。
   • 存在其他过错方：如果公司未代扣代缴增值税是由于对方的原因（如对方未提供必要的税务资料等）导致的，那么在这种情况下，责任承担可能会有所不同。具体责任划分需要根据合同约定和实际情况来判断。

4. 法律建议

   • 审查合同条款：建议双方在签订合同时，明确约定代扣代缴增值税的具体条款，包括责任划分、违约责任等，以避免后续纠纷。
   • 及时沟通协商：如果发生公司未代扣代缴增值税的情况，双方应当及时沟通协商，寻求解决方案。如果无法协商解决，可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。
   • 咨询专业律师：在处理此类纠纷时，建议咨询专业律师的意见。律师可以根据具体情况提供法律建议，帮助双方更好地解决纠纷。

举例说明：假设A公司与B公司签订了一份销售合同，合同中约定A公司负责代扣代缴B公司应缴纳的增值税。然而，在合同履行过程中，A公司并未实际缴纳该税款。在这种情况下，如果合同中没有特别约定责任承担方式，那么根据合同法和税务法规的相关规定，A公司应当承担未缴纳增值税的责任，并可能需要向B公司支付违约金或赔偿损失。同时，税务机关也有权对A公司进行处罚。

后续行动建议：如果您或您的公司遇到了类似的问题，建议首先审查合同条款，了解双方的权利和义务。然后，及时与对方沟通协商，寻求解决方案。如果无法协商解决，可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。在此过程中，如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。