结论前置：员工因违反公司制度被辞退且扣工资，是否能获得赔偿，主要取决于公司规章制度的合法性、员工违规行为的严重性、公司辞退及扣工资程序的合规性。若公司合法合规地解除劳动合同并扣工资，则无需支付赔偿金；反之，则需按法律规定支付相应的赔偿金。

一、公司合法解除劳动合同并扣工资的情况

根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条，劳动者严重违反用人单位的规章制度时，用人单位可以解除劳动合同且无需承担经济补偿责任。同时，若公司规章制度中明确规定了因员工违规行为可扣除相应工资，且该规定合法合理，公司也有权扣除相应工资。要满足这一条件，需同时符合以下几点：

1. 制度制定程序合法：公司规章制度的制定应经过民主程序，如职工代表大会或全体职工讨论，并与工会或职工代表平等协商确定，之后进行公示或告知劳动者。
2. 制度内容合理合法：规章制度的内容不得违反法律法规的强制性规定，且应合理。例如，规定旷工三天及以上可解除劳动合同并扣除相应工资通常被认为是合理的。
3. 员工确实严重违反制度：员工的行为必须达到严重违反规章制度的程度，如多次旷工、严重失职等。

二、公司违法解除劳动合同或扣工资的情况

在以下情况下，公司辞退员工或扣工资可能构成违法，员工有权要求赔偿：

1. 制度本身违法或不合理：如果公司的规章制度内容与法律法规相抵触，或者明显不合理（如规定迟到一分钟即辞退并扣除全部工资），依据这样的制度辞退员工或扣工资属于违法解除或违法扣工资。
2. 制度未有效公示或告知员工：公司未通过合理方式将规章制度告知员工，如未组织学习、未在公司显著位置公示等，导致员工不知晓相关制度，此时依据该制度辞退员工或扣工资也是违法的。
3. 员工行为未达到严重违反程度：即使规章制度合法有效，但如果员工的违规行为并不严重，公司却以此为由辞退员工或扣除大量工资，同样构成违法解除或违法扣工资。
4. 公司未履行法定程序：公司在辞退员工时未遵循法定程序，如未提前通知、未给予申辩机会等，也构成违法解除劳动合同。同时，若公司扣工资未遵循法定程序或未说明扣工资的具体原因和依据，也可能构成违法扣工资。

三、赔偿金的计算与支付

如果公司违法解除劳动合同或违法扣工资，员工有权要求赔偿金。赔偿金的计算标准如下：

• 经济补偿金：经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
• 经济赔偿金：如果公司违法解除劳动合同，应当依照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。若公司违法扣工资，员工有权要求公司返还被扣的工资，并可能要求公司支付额外的赔偿金（具体数额根据实际情况和法律规定确定）。

四、维权途径与建议

员工对公司的辞退决定或扣工资行为有异议时，可通过以下途径维护自己的权益：

1. 与公司协商：首先尝试与公司协商解决，寻求双方都能接受的方案。
2. 向劳动监察部门投诉：若协商无果，可向当地劳动监察部门投诉，请求其介入调查并处理。
3. 申请劳动仲裁或提起诉讼：若劳动监察部门未能解决问题，员工可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或直接向人民法院提起诉讼，以维护自己的合法权益。

总结与建议：在面临员工因违反公司制度被辞退且扣工资的问题时，首先应审查公司规章制度的合法性与合理性，以及员工违规行为的性质与严重程度。同时，还需考虑公司辞退及扣工资程序的合规性。为确保自身权益，建议公司在制定规章制度时严格遵守法律法规，并保留充分的证据以应对可能的纠纷。而员工在遭遇此类问题时，也应积极了解并维护自己的合法权益，如有需要可直接向我咨询相关法律问题。