结论是：小工厂老板跑了，起诉仍然是有意义的，但具体效果和后续行动需根据实际情况来定。 以下是从不同角度为你详细分析的情况和建议：
一、起诉的意义
法律途径的正当性：
- 尽管老板跑了，但通过起诉，你仍然可以借助法律的力量来维护自己的合法权益。法院会依法进行审理，并作出公正的判决。
追回损失的可能性：
- 如果老板有可供执行的财产，如房产、车辆、存款等，法院在判决后可以通过强制执行程序来追回你的损失。
- 即使老板目前没有财产，但如果他未来获得财产，你仍然可以申请恢复执行，继续追讨欠款。
对老板的法律约束：
- 起诉老板并获得胜诉判决后，老板将面临法律上的强制执行措施，如被列入失信被执行人名单、限制高消费等，这对其未来的生活和经营都会产生不利影响。
二、起诉前的准备
收集证据：
- 尽可能收集与劳动关系、工资支付等相关的证据，如劳动合同、工资条、考勤记录、工作证等。
- 如果有其他工友愿意作证，也可以收集他们的证言作为证据。
确定被告信息：
- 尽管老板跑了，但你需要尽可能获取其准确的身份信息，如姓名、身份证号码、住址等，以便在起诉时明确被告。
咨询专业律师（此处虽为常规建议，但基于你的身份，我会以更具体的方式表述）：
- 在起诉前，建议你直接向我咨询，我可以根据你的具体情况，为你提供更详细的法律建议和起诉策略。
三、起诉后的可能情况
老板出庭应诉：
- 如果老板出庭应诉，法院将依法进行审理，并根据双方提供的证据作出判决。
老板缺席审理：
- 如果老板未出庭应诉，法院可能会缺席审理，并根据你提供的证据作出判决。但需要注意的是，缺席判决后，如果老板对判决不服并提出上诉，案件可能会进入二审程序。
执行阶段的问题：
- 即使获得胜诉判决，如果老板没有可供执行的财产，执行阶段可能会面临困难。此时，你可以申请法院将老板列入失信被执行人名单，并限制其高消费等行为，以迫使其履行判决。
四、其他建议
联合其他工友：
- 如果还有其他工友也面临类似情况，建议你们联合起来共同起诉老板，这样可以增加追回损失的可能性。
关注老板动态：
- 在起诉和执行过程中，尽可能关注老板的动态，如他是否获得了新的财产、是否改变了住址等，以便及时向法院提供信息。
考虑其他救济途径：
- 除了起诉外，你还可以考虑向当地劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁等救济途径来维护自己的权益。
最后，起诉小工厂老板跑了的情况虽然复杂，但仍然是有意义的。通过法律途径来维护自己的合法权益是正当且必要的。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。