关于补充协议是否可以改变付款方式的问题，这并非一个绝对禁止或绝对允许的行为，而是需要根据具体情况、相关法律法规以及合同条款来综合判断。以下是对此问题的详细解答：
一、法律依据与原则
《中华人民共和国民法典》：该法典明确规定，当事人协商一致可以变更合同。这为合同变更提供了基本的民事法律基础，意味着在双方同意的情况下，付款方式等合同条款是有可能通过补充协议进行变更的。
《中华人民共和国招标投标法》及其实施条例：这些法规对招标人和中标人签订合同有明确规定，要求按照招标文件和中标文件订立书面合同，并不得再行订立背离合同实质性内容的其他协议。付款方式作为合同的重要条款，其变更可能构成对合同的实质性变更，因此需要谨慎处理。
二、可以签订补充协议改变付款方式的情形
合同有相关约定：如果原合同中已明确允许通过补充协议变更付款方式等条款，并且双方按照合同约定的程序和条件进行，则此种变更合法有效。
出现特殊客观情况：在合同履行过程中，若遇到订立合同时无法预见的重大变化（如国家金融政策调整、不可抗力导致的资金周转困难），且继续按原付款方式履行对一方明显不公平，双方可协商签订补充协议变更付款方式。
未实质性改变合同内容：如果付款方式的变更未对双方的基本权利义务造成实质影响，如仅调整付款时间而不改变总金额或支付比例，则可能不被视为实质性变更。此时，双方可通过协商一致签订补充协议进行变更。
三、不可以签订补充协议改变付款方式的情形
实质性变更合同：如果付款方式的变更直接影响了当事人的基本权利，如显著延长支付期限或改变支付比例，导致一方利益受损，则很可能被视为实质性变更。此类变更通常需重新组织招标或经原招标审批部门批准后方可实施。
违反招投标文件规定：如果补充协议改变付款方式违反了招投标文件中的相关规定（如招标文件明确规定付款方式且不允许更改），则该补充协议可能不具有法律效力。
损害其他投标人利益：通过不合理地改变付款方式，使中标人获得不正当的竞争优势，可能损害其他未中标投标人的合法权益，破坏公平竞争的市场秩序。这种补充协议面临法律风险，并可能引发质疑和投诉。
四、建议与注意事项
谨慎行事：在考虑改变付款方式时，应充分评估法律风险和潜在后果，避免不必要的法律纠纷。
咨询专业意见：在签订补充协议前，建议咨询专业律师或法律顾问，确保所拟定的协议内容合法合规。
明确变更内容：如果确需变更付款方式，应签订书面补充协议，并由双方签字盖章确认。补充协议的内容应清晰、具体、无歧义，且不得违背原招标文件和投标文件的实质性内容。
特殊情况审批：对于因不可抗力等不可预见、不可避免的客观原因导致原付款方式无法执行的情况，应及时向原招标审批部门报告并申请批准变更。
综上所述，补充协议是否可以改变付款方式取决于多种因素，包括合同条款、法律法规、变更的性质和风险等。在处理此类问题时，应谨慎行事、咨询专业意见，并确保变更的合法性和有效性。