针对您提出的“拖欠农民工工资小老板找不到了但有公司的打款记录，劳动法该怎么办”这一问题，以下是我的详细解答：
明确维权路径：
- 收集证据：首先，您需要收集所有能证明劳动关系和欠薪事实的证据，包括但不限于劳动合同、考勤记录（如打卡记录、考勤表）、工作证、工服、工牌、工资条或工资转账记录（特别是您提到的公司打款记录，这是非常关键的证据）。此外，如果有工友愿意出具书面证言并签字按手印，也能增强证据效力。同时，保留与老板或相关负责人的短信、电话录音、微信聊天记录等沟通记录也很重要。
- 向相关部门求助：您可以拨打劳动监察部门的投诉电话（如12333）或现场投诉，向当地劳动监察大队反映情况。劳动监察部门有权调查并责令用人单位支付工资。如果涉及建筑工程项目欠薪，您还可以向住房和城乡建设局等部门反映，这些部门会对工程项目的工资支付情况进行监管。
申请劳动仲裁：
- 程序简介：若劳动监察部门处理无果，您可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。在申请仲裁时，您需要提交仲裁申请书及相应证据材料。
- 裁决效力：仲裁裁决具有法律效力，用人单位需按裁决结果支付工资。如果用人单位拒不履行裁决，您可以向法院申请强制执行。
- 特殊情形处理：即使找不到小老板，劳动仲裁委员会也可以通过公告送达等方式进行仲裁程序，确保您的权益得到保障。
寻求法律援助与诉讼：
- 法律援助：如果您符合法律援助条件，可以获得免费法律帮助和代理服务。您可以通过实体平台（如公共法律服务中心、法律援助中心）、热线平台（如12348公共法律服务热线）或网络平台申请法律援助。
- 提起诉讼：若仲裁未能解决问题，或者您对仲裁结果不满意，您可以向人民法院提起诉讼。在提起诉讼前，请确保您已经收集了充分的证据来支持您的主张。法院将根据事实和法律进行判决，并要求用人单位支付拖欠的工资及可能的赔偿金。
考虑刑事报案：
- 如果小老板有恶意欠薪的嫌疑，且情节严重，可能构成拒不支付劳动报酬罪。在这种情况下，您可以向公安机关报案，追究其刑事责任。
法律背景与建议：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第九十一条，用人单位克扣或者无故拖欠劳动者工资的，由劳动行政部门责令支付劳动者的工资报酬、经济补偿，并可以责令支付赔偿金。因此，您在维权过程中可以依据此条款来主张自己的权益。
- 在整个维权过程中，请保持冷静和理性，避免采取过激行为。同时，务必保留好所有相关证据，以便在需要时提供证明。
可能遇到的法律后果：
- 如果用人单位最终被责令支付工资但拒不履行，可能会面临法院的强制执行措施，包括查封、扣押、拍卖财产等。
- 如果用人单位的行为构成拒不支付劳动报酬罪，其直接负责的主管人员和其他直接责任人员可能会受到刑事处罚。
总结与建议：
面对拖欠农民工工资且小老板找不到的情况，您应充分利用法律武器来维护自己的合法权益。首先做好证据收集工作，然后向相关部门求助并申请劳动仲裁。如果问题仍未解决，可以考虑寻求法律援助或提起诉讼。在整个过程中，保持冷静和理性至关重要。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。