关于“总承包转包工程的发包人可扣除一半工程款”的约定效力，我们可以从以下几个方面进行详细分析：

1. 合同法基本原则：

   • 根据合同法的自愿原则，当事人有权依法自由订立合同，但合同内容必须合法、公平，且不违反公序良俗。
   • 若“扣除一半工程款”的约定存在显失公平或重大误解等情形，该条款可能被视为无效或部分无效。

2. 建设工程合同特性：

   • 建设工程合同通常涉及大额资金、长期合作及复杂的技术要求。
   • 发包人与承包人之间的权利义务关系应明确、公平，以确保工程顺利进行。
   • 若该约定导致承包人无法获得合理报酬，可能构成对承包人的不公平，进而影响合同的稳定性和执行力。

3. 法律法规约束：

   • 《中华人民共和国建筑法》、《中华人民共和国合同法》（现已被《中华人民共和国民法典》替代）等法律法规对建设工程合同的订立、履行及争议解决均有明确规定。
   • 若该约定违反相关法律法规的强制性规定，如低于成本价中标、恶意压价等，则该约定无效。

4. 实际履行情况：

   • 需考虑该约定在实际履行过程中的可操作性及可能产生的法律后果。
   • 若承包人因该约定遭受重大损失，可能引发诉讼或仲裁，进而影响双方合作关系及项目进展。

综上所述，“总承包转包工程的发包人可扣除一半工程款”的约定效力并非绝对，而需根据具体情况进行判断。若该约定存在显失公平、违反法律法规强制性规定或无法实际履行等情形，该条款可能被视为无效或部分无效。因此，在签订此类合同时，建议双方务必谨慎考虑，确保合同内容合法、公平且具备可操作性。如有任何疑问或争议，可及时向我咨询，我将为你提供专业的法律意见和解决方案。