在处理第三方支付公司代发工资的举证问题时，我们主要需要从以下几个方面来准备和提交证据：

1. 合同或协议证明：

   • 首先，应提供与第三方支付公司之间签订的代发工资合同或协议。这是最直接且有力的证据，能够明确双方的权利和义务，包括代发工资的具体条款、金额、时间等。

2. 支付记录：

   • 提交第三方支付公司的支付记录，包括电子支付凭证、银行转账记录等。这些记录应能清晰显示工资款项从第三方支付公司账户转入员工账户的过程。

3. 员工收款证明：

   • 提供员工收到工资后的收款证明，如银行流水、支付宝或微信等第三方支付平台的收款记录。这可以进一步证实工资已经成功发放到员工手中。

4. 税务申报记录：

   • 如果可能，提交与代发工资相关的税务申报记录。这可以证明第三方支付公司代发的工资已经按照国家规定进行了税务处理。

5. 其他辅助证据：

   • 根据具体情况，可能还需要提供其他辅助证据，如员工名单、工资明细表、考勤记录等，以进一步证明代发工资的真实性和合法性。

在准备这些证据时，请确保它们的真实性、合法性和关联性，并尽量形成完整的证据链。如果遇到困难或不确定如何操作，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更详细的指导和建议。