针对你提出的问题，关于“父亲失踪三十年有一宅基地房产，大儿子私自拆建，小儿子能否起诉”，以下是我的详细解答：

结论：小儿子在特定情况下有权起诉大儿子私自拆建宅基地房产的行为。

分析说明：

1. 宅基地房产的归属：

   • 宅基地通常属于农村集体所有，但宅基地上的房屋属于个人财产，可以继承。
   • 若父亲失踪前未对宅基地房产进行处分，则该房产可能仍属于父亲所有，或根据家庭情况由其他家庭成员共有。
   • 若父亲已宣告失踪或死亡，且未留下遗嘱，则宅基地上的房产应按照法定继承顺序由继承人继承。

2. 大儿子私自拆建的法律后果：

   • 若大儿子未经其他继承人同意或未获得必要许可，私自拆建宅基地房产，可能构成对他人财产权的侵犯。
   • 小儿子作为可能的继承人之一，若其继承权被侵犯，有权提起诉讼要求保护其合法权益。

3. 起诉的法律依据：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，公民合法的私有财产受法律保护，任何组织或个人不得侵占、哄抢、破坏。
   • 若大儿子的行为构成侵权，小儿子可以依据民法典的相关规定提起诉讼，要求大儿子停止侵害、排除妨碍、赔偿损失等。

4. 起诉的可行性：

   • 小儿子在起诉前需要收集相关证据，如宅基地使用权证、房产证明、大儿子私自拆建的证据等。
   • 若证据充分，且小儿子的起诉符合法律规定的起诉条件，则法院可能会受理并审理此案。

5. 其他考虑因素：

   • 若父亲仍下落不明，可能需要先通过法律程序宣告其失踪或死亡，以确定继承人的身份和继承份额。
   • 若宅基地房产涉及其他家庭成员的共有权，还需要考虑共有权的分割和处置问题。

综上所述，小儿子在特定情况下有权起诉大儿子私自拆建宅基地房产的行为。但具体能否起诉以及起诉的结果如何，还需要根据具体的法律事实和证据来判断。若你有进一步的法律问题或需要详细的法律帮助，请直接向我咨询。