若个人行为导致公司收入违法，处理方式需根据行为性质、公司责任及法律后果综合判断，具体如下：

1. 个人行为的法律定性

   • 若个人行为属于职务行为（如利用职权虚构交易、虚开发票、挪用资金等），且目的是为公司谋取利益，则可能构成单位犯罪的直接责任人员。此时公司需承担刑事责任（如逃税罪、虚开发票罪等），个人也可能被追究主犯或从犯责任。
     
   • 若个人行为属于个人行为（如员工私自收取客户款项未入账、利用公司资源从事个人业务等），且公司未参与或不知情，则个人需单独承担法律责任（如职务侵占罪、非国家工作人员受贿罪等），公司可能作为受害方主张民事赔偿。
     

2. 公司的法律责任与应对

   • 刑事责任风险：若公司被认定为单位犯罪，需承担罚金等刑事责任，同时直接负责的主管人员和其他直接责任人员（如法定代表人、财务负责人）可能被判刑。公司需立即停止违法行为，配合调查，并主动补缴税款、罚款等，以争取从轻处理。
     
   • 民事赔偿义务：无论个人行为是否构成犯罪，公司均可能因收入违法面临行政处罚（如税务机关追缴税款、加收滞纳金、罚款），或被交易相对方主张合同无效、赔偿损失等民事责任。公司需通过内部追责（如向个人索赔）或外部协商（如与交易方和解）降低损失。
     
   • 内部管理整改：公司需审查内部控权机制（如财务审批流程、业务合规审查），对涉事员工进行纪律处分或解雇，并完善合规制度（如建立反舞弊机制、加强员工法律培训），以避免类似事件再次发生。
     

3. 个人的法律后果与救济

   • 刑事处罚：若个人行为构成犯罪（如逃税、虚开发票、职务侵占等），可能面临有期徒刑、罚金等刑罚。个人可争取自首、立功、认罪认罚等情节，以减轻处罚。
     
   • 民事赔偿：公司或交易相对方可能要求个人赔偿损失（如补缴税款、返还侵占资金、赔偿合同违约损失等）。个人需评估自身偿付能力，必要时与对方协商分期赔偿或以物抵债。
     
   • 劳动争议处理：若个人被公司解雇，可能引发劳动仲裁（如主张违法解除赔偿金）。个人需收集证据（如公司规章制度、行为性质证明），以维护自身权益。
     

建议行动步骤：

• 公司层面：立即停止违法行为，委托律师评估法律风险，配合行政/刑事调查，主动整改并补缴税款/罚款，向涉事员工追责。
  
• 个人层面：咨询律师分析行为性质，若构成犯罪尽早自首，配合调查争取从宽处理；若面临民事赔偿，与对方协商和解或准备应诉材料。
  

如有进一步细节（如行为具体方式、公司类型、是否已立案等），可直接向我咨询，我会结合具体情形提供更精准的建议。