针对您提出的“事业单位工作人员违规收入怎么处理”这一问题，以下是我为您提供的详细解答：

事业单位工作人员违规收入是一个需要严肃对待的问题，它不仅关乎公共财政资金的安全和合规使用，也影响着事业单位的纪律和秩序。对于此类问题，处理方式需依据相关法律法规和纪律规定，结合具体情况进行严肃处理。

一、调查核实与认定违规性质

1. 启动调查：一旦发现事业单位人员可能存在违规收入行为，其所在单位、上级主管部门或纪检监察机关应立即启动调查程序。调查过程需全面、公正，确保事实清晰无误。

2. 收集证据：通过查阅财务账目、文件资料、合同协议及银行流水等多种方式，全面收集证明违规收入行为的证据。这些证据应包括涉及金额、违规方式等关键信息。

3. 依据法规政策判断：根据《事业单位工作人员处分暂行规定》、相关财政法规及本单位内部薪酬管理制度，判断该收入行为是否违规，并明确违规的具体情形。

4. 确定责任程度：结合调查结果，明确涉事人员在违规收入行为中的责任大小，区分主要责任、次要责任和共同责任，为后续处理提供依据。

二、处理措施

1. 纪律处分：

   • 根据违规情节轻重，给予警告、记过、降低岗位等级或者撤职、开除等纪律处分。这些处分将影响涉事人员的岗位晋升、职称评定、绩效工资分配等。
   • 纪律处分的影响期分别为：警告6个月，记过12个月，降低岗位等级或者撤职24个月。在影响期内，受处分人员需接受相应的限制和约束。

2. 经济处理：

   • 责令违规人员退还全部违规所得，确保公共财政资金的安全和合规使用。这是处理违规收入行为的重要环节，也是恢复公共财政秩序的必要措施。
   • 视情况对违规人员处以罚款，罚款金额根据违规情节和后果确定。罚款旨在惩罚违规行为，并起到警示作用。

3. 法律制裁：

   • 如违规收入行为构成违法，将依法受到相关行政部门的处罚，如罚款、没收违法所得等。
   • 在极少数情况下，如果违规收入行为构成犯罪（如贪污、受贿等），将依法追究刑事责任，涉事人员将面临法律的严惩。

4. 其他处理：

   • 对情节较轻的违规行为，可进行诫勉谈话，批评教育并要求书面检讨。这种方式旨在通过教育和引导，帮助涉事人员认识错误并改正。
   • 在一定范围内通报批评违规行为，以警示其他人员。通报批评可以扩大影响范围，增强警示效果。

三、后续监督与整改

1. 跟踪监督：确保处理决定得到切实执行，包括退还违规所得、接受纪律处分等。跟踪监督是确保处理效果的重要环节。

2. 制度完善：针对违规事件暴露的制度漏洞和管理问题，完善薪酬管理制度、财务监管制度、人员兼职管理规定等。制度完善是防止类似问题再次发生的根本措施。

3. 加强预防与监管：

   • 建立健全薪酬管理的监督和审计机制，加强对事业单位人员薪酬的监管。通过定期审计和监督，及时发现和纠正违规行为。
   • 加强宣传教育，提高事业单位人员的法律意识和职业道德水平。通过培训和教育活动，增强涉事人员的自律意识，减少违规行为的发生。

综上所述，对于事业单位工作人员违规收入的问题，必须采取严肃认真的态度进行处理。通过调查核实、认定违规性质、采取处理措施以及加强后续监督与整改等措施，确保公共财政资金的安全和合规使用，维护事业单位的纪律和秩序。同时，通过加强预防和监管工作，从根本上避免类似问题的发生，保障事业单位的健康发展。