单位对医疗期开具诊断证明的医院进行指定，这一行为是否合法，需分情况讨论：

1. 若单位指定医院符合法律法规及劳动合同约定：

   • 在某些情况下，单位可能基于管理需要或行业规范，与特定医院建立合作关系，要求员工在医疗期前往指定医院就诊并开具诊断证明。这种做法若事先在劳动合同中明确约定，且该医院具备相应的医疗资质和诊断能力，同时不违反法律法规的强制性规定，那么这种指定行为通常是合法的。
   • 法律依据：虽然直接的法律条文可能并未明确提及单位可以指定医院，但根据《劳动合同法》的相关规定，劳动合同双方可以就工作内容、工作地点等事项进行约定。若指定医院作为劳动合同的一部分，且双方均同意，则该约定有效。

2. 若单位指定医院违反法律法规或劳动合同约定：

   • 如果单位未经员工同意，单方面强制要求员工前往指定医院就诊，且该医院不具备相应的医疗资质或诊断能力，或者该指定行为违反了法律法规的强制性规定（如侵犯了员工的自主选择权等），那么这种指定行为是不合法的。
   • 法律后果：员工有权拒绝单位的指定要求，并可以选择前往自己信任的、具备相应资质的医院就诊。若单位因此对员工进行处罚或解除劳动合同，员工可以依法维护自己的合法权益，包括向劳动争议调解仲裁机构申请仲裁或向人民法院提起诉讼。

3. 特殊情况下的考虑：

   • 在某些特殊行业或岗位中，如涉及职业病防治、传染病防控等，单位可能根据相关法律法规的要求，指定特定的医疗机构进行诊断和治疗。这种情况下，单位的指定行为通常是合法的，但也需要确保该指定行为符合法律法规的具体规定，并保障员工的合法权益。

建议：

• 对于员工而言，若单位要求前往指定医院就诊并开具诊断证明，应首先查看劳动合同中是否有相关约定，并了解该医院的资质和诊断能力。若对单位的指定有疑问或不满，可以与单位进行沟通协商，或寻求法律援助。
• 对于单位而言，若需指定医院进行诊断和治疗，应确保该指定行为符合法律法规和劳动合同的约定，并充分保障员工的合法权益。同时，也可以考虑与多家医院建立合作关系，为员工提供更多的选择空间。

总结：单位对医疗期开具诊断证明的医院进行指定是否合法，需根据具体情况进行判断。若您在此方面遇到法律问题或困惑，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律意见。