结论：甲方因拖欠工程款而提出的质量问题，在工程已经五方验收并备案的情况下，并不必然需要进行质量鉴定，但具体是否需要鉴定还需结合实际情况判断。以下从不同角度进行分析：
一、五方验收并备案的法律效力
五方验收（通常指建设单位、施工单位、设计单位、监理单位、勘察单位共同参与的验收）并备案是工程竣工验收的重要环节，具有法律效力。一旦工程通过五方验收并备案，通常意味着工程在质量、安全等方面符合相关标准和要求，可以交付使用。因此，在一般情况下，如果工程已经五方验收并备案，甲方再以质量问题为由拖欠工程款，其主张可能缺乏充分依据。
二、质量鉴定的必要性
甲方有初步证据或合理怀疑：
- 如果甲方能够提供初步证据或合理怀疑工程存在质量问题，且该问题可能影响工程的安全、使用功能或耐久性，那么甲方有权要求进行质量鉴定。
- 初步证据可以包括施工过程中的质量监督报告、监理日志、现场照片或视频等。
法院或仲裁机构认为必要：
- 在诉讼或仲裁过程中，如果法院或仲裁机构认为有必要对工程质量进行鉴定，以查明事实、分清责任，那么可以委托具有相应资质的鉴定机构进行质量鉴定。
- 这种情况下，质量鉴定的结果将作为判决或裁决的重要依据。
双方协商一致：
- 如果双方对工程质量存在争议，且均同意通过质量鉴定来解决争议，那么可以进行质量鉴定。
- 这种情况下，质量鉴定的结果将对双方具有约束力。
三、不进行质量鉴定的可能情况
甲方无法提供初步证据或合理怀疑：
- 如果甲方无法提供任何初步证据或合理怀疑工程存在质量问题，那么其要求进行质量鉴定的主张可能不会被支持。
工程已过质保期且无质量问题：
- 如果工程已经过了质保期，且在使用过程中未出现任何质量问题，那么甲方再以质量问题为由拖欠工程款的主张可能缺乏合理性。
双方已就质量问题达成协议：
- 如果双方已经就工程质量问题达成协议，并明确了责任承担方式，那么甲方再要求进行质量鉴定的主张可能不会被支持。
四、法律建议
对于乙方（施工单位）：
- 如果甲方以质量问题为由拖欠工程款，且工程已经五方验收并备案，乙方可以要求甲方提供初步证据或合理怀疑工程存在质量问题的依据。
- 如果甲方无法提供，乙方可以拒绝进行质量鉴定，并要求甲方按照合同约定支付工程款。
- 如果甲方坚持要求进行质量鉴定，乙方可以积极配合，但应要求甲方承担鉴定费用，并在鉴定结果出来后根据结果处理工程款支付问题。
对于甲方（建设单位）：
- 如果甲方认为工程存在质量问题，且该问题可能影响工程的安全、使用功能或耐久性，甲方应尽快收集初步证据或合理怀疑的依据，并与乙方协商解决。
- 如果协商无果，甲方可以考虑通过法律途径解决争议，包括要求进行质量鉴定。但在此过程中，甲方应做好承担鉴定费用和可能败诉的风险准备。
最后，如果在实际操作中遇到复杂情况或争议无法解决，建议直接向我咨询，我会根据具体情况提供更详细的法律建议。