面对双方都有土地凭证却发生纠纷的情况，您可以按照以下步骤来处理和解决这一问题：

一、详细梳理纠纷情况

首先，您需要清晰地了解纠纷的具体情况，包括：

• 纠纷对象：是与个人、单位还是政府等产生了纠纷？
• 纠纷起因：是因为土地使用范围、使用方式、权属争议还是其他原因？
• 关键点：纠纷的核心问题是什么？
• 双方主张和诉求：您和对方各自的主张是什么？希望达到什么样的解决结果？

二、尝试协商解决（优先推荐）

在了解纠纷情况后，我建议您首先尝试与对方进行协商。协商解决的优势在于高效且能维护双方关系，避免法律程序的繁琐。在协商过程中，您应：

• 保持平等、自愿、互谅的原则：尊重对方的意见和诉求，寻求双方都能接受的解决方案。
• 就核心问题展开沟通：明确土地使用范围、方式等关键问题，力求达成一致意见。
• 签订书面协议：如果协商成功，务必签订书面协议以固化成果，避免后续再次产生纠纷。

三、寻求调解解决

如果协商无果，您可以考虑寻求调解解决。调解可以由第三方或政府部门进行：

• 第三方调解：您可以寻求村委会、居委会或人民调解委员会等基层组织的帮助。这些组织通常具备丰富的调解经验和权威性，能够协助您和对方达成和解。
• 政府调解：根据《土地管理法》的规定，单位间的争议由县级以上人民政府处理，个人与个人、个人与单位间的争议则由乡级或县级以上人民政府处理。您可以向相关政府部门提出调解申请，等待政府部门的介入和调解。

在调解过程中，您应如实陈述事实，提供相关证据，积极接受调解方案，以期达成和解。

四、考虑仲裁解决（如果双方有约定）

如果双方在土地使用合同中已约定仲裁条款，或在纠纷发生后达成仲裁协议，您可以选择仲裁方式解决纠纷。仲裁解决的优势在于程序相对简便，且仲裁裁决具有法律效力。在仲裁过程中，您应：

• 向约定的仲裁机构提交仲裁申请：并按照仲裁机构的程序要求参与审理。
• 遵守仲裁裁决：仲裁裁决作出后，您必须履行裁决结果。

五、作为最后手段，提起诉讼解决

如果协商、调解、仲裁均无法解决问题，您可以向人民法院提起诉讼。诉讼解决是维护自身权益的最终手段。在诉讼过程中，您应：

• 准备充分的证据材料：包括起诉状、土地使用证、相关合同、协议、证人证言等。
• 向有管辖权的法院提交起诉状及证据材料：并缴纳诉讼费。
• 参与法院的开庭审理：进行陈述、举证、质证和辩论。
• 遵守法院判决：根据审理情况，法院将作出判决。您应遵守判决结果，如果对一审判决不服，可以在规定时间内提起上诉。

六、注意事项与建议

• 重视证据收集与保存：在整个纠纷处理过程中，您应高度重视证据的收集与保存工作。证据是维护自身权益的关键，务必确保证据的完整性和真实性。
• 咨询专业律师：在处理复杂或难以把握的法律问题时，我建议您咨询专业律师的意见。律师能够为您提供更专业和针对性的指导，帮助您更好地维护自身权益。
• 理性表达诉求：无论选择何种解决方式，您都应保持冷静理性，遵守法律法规和程序规定。通过合法途径表达诉求，避免采取过激行为或违法手段。

综上所述，面对双方都有土地凭证却发生纠纷的情况，您应根据实际情况灵活选择解决途径，并在整个过程中注重证据的收集与保存，同时寻求专业律师的帮助以确保自身权益得到有效维护。