针对已颁发土地证但存在纠纷的情况，核心处理原则是依据纠纷类型选择协商、行政复议、行政诉讼或民事诉讼等途径解决，具体分析如下：

1. 明确纠纷类型是关键

• 权属争议：若纠纷涉及土地使用权归属（如家庭成员间、邻里间对土地边界或权属的争议），需先通过协商或调解解决。若协商不成，可向当地自然资源部门（原国土部门）申请确权，或直接向法院提起民事诉讼（依据《土地管理法》第14条）。
• 登记错误争议：若土地证内容（如面积、四至范围）与实际不符，可能是登记错误。此时应向颁发土地证的机关申请更正登记，或通过行政诉讼要求撤销错误登记（依据《不动产登记暂行条例实施细则》第79-82条）。
• 行政行为违法争议：若认为颁发土地证的行为违法（如程序违法、超越职权），可向上级自然资源部门申请行政复议，或直接向法院提起行政诉讼（依据《行政复议法》第12条、《行政诉讼法》第12条）。

2. 处理步骤建议

• 第一步：收集证据
  包括土地证原件、历史权属证明（如合同、遗嘱、分家协议）、相邻土地权属证明、现场照片、证人证言等，以证明己方主张。
• 第二步：协商或调解
  优先通过村委会、居委会或人民调解委员会协调，降低解决成本。若达成协议，可签订书面和解协议并公证。
• 第三步：行政或司法途径
  
  • 若涉及登记错误或行政违法，需在知道或应当知道行政行为之日起6个月内提起行政诉讼（或60日内申请行政复议），逾期可能丧失权利。
  • 若涉及民事权属争议，可直接向法院起诉，诉讼时效为3年（自知道权利受损之日起计算）。

3. 注意事项

• 土地证效力：已颁发的土地证具有公示公信力，未经法定程序撤销前，推定其合法有效。纠纷处理中需重点证明登记内容与事实不符或程序违法。
• 诉讼风险：行政诉讼中，被告（行政机关）需举证证明其行为的合法性，原告（争议方）只需证明行政行为可能侵犯其权益即可立案。
• 执行问题：若法院判决支持更正登记或撤销土地证，需及时向自然资源部门申请执行，避免判决成为“一纸空文”。

建议：根据纠纷类型选择合适途径，优先协商调解；若涉及行政行为合法性，务必在法定期限内启动程序；处理过程中注意固定证据，必要时委托律师协助。如有具体案情，可进一步向我咨询细节。