当争议双方都持有土地证时，核心处理方式需结合土地权属争议的实质审查程序进行，具体分以下两种情况处理：

1. 若两证存在明显冲突（如四至范围重叠、面积矛盾）

• 法律程序：根据《土地管理法》第14条，双方应先向县级以上人民政府申请土地权属争议调查处理。政府会通过实地勘界、调取历史档案、询问当事人等方式，核查两证的合法性及效力优先级。
• 关键证据审查：
  • 发证时间：后颁发的土地证若未注销前证，可能因“一地两证”被撤销；
  • 程序合法性：若某证存在未公告、未实地勘界、超越审批权限等程序瑕疵，可能被认定无效；
  • 实际使用情况：长期实际占有、使用土地的证据（如纳税凭证、村集体证明）可能成为权属判断的辅助依据。
• 结果示例：若政府认定一方土地证合法有效，另一方需通过行政诉讼撤销该证；若两证均存在瑕疵，可能被同时撤销并重新确权。

2. 若两证范围无重叠但存在边界模糊（如相邻地块界线争议）

• 处理路径：
  • 协商划界：双方可依据《民法典》第288条，按照有利生产、方便生活、团结互助、公平合理的原则，自行协商划定边界并签订协议；
  • 行政调解：向乡镇政府或自然资源部门申请调解，调解协议经司法确认后具有强制执行力；
  • 司法确权：若协商、调解无果，可直接向法院提起土地权属确认之诉，法院将委托测绘机构明确界址点坐标，并出具判决书作为权属依据。
• 实务建议：无论选择哪种方式，均建议同步申请土地现状测绘，固定争议地块的实际范围，避免后续证据灭失。

补充提醒：土地权属争议处理期间，任何一方不得改变土地利用现状或破坏地上附着物，否则可能承担赔偿责任。若涉及集体土地与国有土地冲突，还需核查土地征收、出让等程序的合法性。如有具体证据材料（如土地证复印件、争议地块照片），可进一步向我提供，以便分析具体风险点。