结论：公司不能因员工特种作业证复审后未满三年离职而扣钱，除非双方有明确约定且该约定不违反法律法规强制性规定。

分析说明：

1. 法律法规层面：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关法律法规，公司不得随意扣除员工工资或要求员工支付违约金，除非存在法定情形（如员工违反服务期约定或竞业限制约定，并给公司造成损失）。
   • 特种作业证的复审是员工为了保持其从事特种作业的资格而进行的必要程序，与员工离职无直接关联。因此，公司不能因员工特种作业证复审后未满三年离职而主张扣钱。

2. 合同约定层面：

   • 如果公司与员工在劳动合同或相关协议中明确约定了特种作业证复审后未满一定期限离职需支付违约金或扣除部分工资，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么公司可能有权按照约定执行。
   • 但需要注意的是，此类约定必须合法、合理，且不得损害员工的合法权益。如果约定过于苛刻或显失公平，员工有权向劳动争议调解仲裁机构或人民法院申请撤销或变更。

3. 实际操作建议：

   • 对于员工而言，在离职前应仔细阅读劳动合同及相关协议，了解自己的权利和义务。如果公司提出因特种作业证复审后未满三年离职而扣钱的要求，员工可以拒绝并咨询专业律师。
   • 对于公司而言，应遵守法律法规和劳动合同约定，不得随意扣除员工工资或要求员工支付违约金。如果确实需要员工承担某些费用或责任，应在劳动合同或相关协议中明确约定，并确保约定合法、合理。

后续行动建议：

• 如果您作为员工遇到了此类情况，建议首先与公司进行沟通协商，明确双方的权利和义务。
• 如果沟通无果，您可以向当地的劳动争议调解仲裁机构申请调解或仲裁，以维护自己的合法权益。
• 在整个过程中，保留好相关证据（如劳动合同、工资条、扣款通知等）以便在需要时提供证明。

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