在两地管辖存在争议且互不立案的情况下，当事人确实可以申请指定管辖。以下是对这一问题的详细分析：

一、法律依据

根据《中华人民共和国民事诉讼法》第三十八条的规定：“有管辖权的人民法院由于特殊原因，不能行使管辖权的，由上级人民法院指定管辖。人民法院之间因管辖权发生争议，由争议双方协商解决；协商解决不了的，报请它们的共同上级人民法院指定管辖。”这一条款明确规定了在管辖权争议且协商无果的情况下，当事人可以申请上级人民法院指定管辖。

二、申请指定管辖的条件

1. 存在管辖权争议：即两个或两个以上的人民法院对同一案件均认为有管辖权，或者均认为无管辖权，从而产生争议。
2. 协商无果：在管辖权争议发生后，相关人民法院应首先尝试通过协商解决争议。如果协商无法达成一致意见，则满足申请指定管辖的条件。
3. 报请共同上级人民法院：在协商无果的情况下，相关人民法院应报请它们的共同上级人民法院指定管辖。对于当事人而言，虽然法律条文未直接规定当事人可以主动申请，但在实践中，当事人可以通过向相关人民法院提出异议或申请的方式，促使法院启动指定管辖程序。

三、申请指定管辖的流程

1. 当事人提出异议或申请：当事人认为存在管辖权争议且协商无果时，可以向有管辖权争议的人民法院提出异议或申请指定管辖。
2. 法院审查并报请上级法院：收到当事人的异议或申请后，相关人民法院会进行审查。如果认为确实存在管辖权争议且协商无果，会报请它们的共同上级人民法院指定管辖。
3. 上级法院指定管辖：共同上级人民法院在收到报请后，会进行审查并作出指定管辖的决定。该决定具有法律效力，相关人民法院必须遵守。

四、注意事项

1. 及时提出异议或申请：当事人在发现管辖权争议后，应及时提出异议或申请，以免耽误诉讼进程。
2. 提供充分证据：当事人在提出异议或申请时，应提供充分的证据证明存在管辖权争议且协商无果。
3. 遵守指定管辖决定：一旦上级人民法院作出指定管辖的决定，相关人民法院和当事人必须遵守，不得再就管辖权问题提出异议或申请。

五、实践建议

1. 咨询专业律师：在面临管辖权争议时，当事人可以咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。虽然此处不直接提及“咨询专业律师”，但强调当事人应寻求专业法律帮助是合理的。
2. 保留相关证据：当事人应妥善保留与管辖权争议相关的所有证据，以便在提出异议或申请时提供有力支持。
3. 关注诉讼进程：在指定管辖过程中，当事人应密切关注诉讼进程，确保自己的权益得到及时维护。

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