结论：销售金额每月不到两万元的个体商店在2009年至现在未纳税，并不构成合法经营。未依法纳税属于违法行为，可能会面临税务机关的处罚。
分析：
纳税义务：
- 根据我国税法的相关规定，无论是企业还是个体工商户，只要发生应税行为，就应当依法纳税。纳税是每个经营者的法定义务，不因经营规模大小或销售额多少而免除。
- 对于个体商店而言，即使每月销售金额不到两万元，如果达到了起征点（具体起征点可能因地区和税种而异，但一般而言，个体工商户的增值税起征点较低，且存在多种税种需要缴纳），就需要依法申报并缴纳税款。
未纳税的法律后果：
- 如果个体商店未依法纳税，税务机关有权进行税务稽查，并要求补缴税款、滞纳金以及可能的罚款。
- 在严重情况下，如逃避缴纳税款数额较大并且占应纳税额百分之十以上的，还可能构成逃税罪，面临刑事处罚。
合法经营的要求：
- 合法经营不仅要求遵守市场规则、不进行欺诈等违法行为，还要求依法履行纳税义务。
- 只有同时满足这些条件，才能被认为是合法经营。
建议：
- 对于该个体商店而言，应尽快向当地税务机关申报并补缴税款，以避免进一步的法律后果。
- 同时，建议该个体商店加强税务知识的学习，了解并遵守相关税法规定，确保未来的经营活动合法合规。
- 如果对税务问题存在疑问或不确定如何处理，可以向专业的税务顾问或律师咨询，以获取更具体的指导和建议。
额外提醒：
- 税务法规可能会随着时间和政策的变化而调整，因此个体商店应定期关注税务法规的更新，确保及时了解并遵守最新的税法要求。
- 合法经营是每个经营者的责任和义务，不仅有助于维护市场秩序和公平竞争环境，也有助于保护经营者自身的合法权益。
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