结论：上班途中出交通事故，若被认定为工伤，单位在停工留薪期内不会扣发工资，反而应按原工资福利待遇支付；若未被认定为工伤，则单位可能根据内部规章制度或劳动合同约定处理工资问题，但通常不会扣发至零，至少会支付病假工资或当地最低工资标准的80%。

详细分析：

1. 认定为工伤的情况：

   • 认定条件：根据《工伤保险条例》第十四条，职工在上下班途中，若受到非本人主要责任的交通事故（包括城市轨道交通、客运轮渡、火车事故）伤害，应被认定为工伤。这意味着，如果交通事故中职工不承担主要责任或全部责任，且发生在上下班途中，那么该事故应被认定为工伤。
   • 工资发放规定：一旦事故被认定为工伤，根据《工伤保险条例》第三十三条，职工在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。停工留薪期一般不超过12个月，伤情严重或情况特殊时，经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认，可适当延长，但延长期限不得超过12个月。因此，在停工留薪期内，单位不会扣发工资，反而应按原工资福利待遇支付。

2. 未认定为工伤的情况：

   • 认定条件：若交通事故中职工本人负主要责任或全部责任，则通常不被认定为工伤。
   • 工资处理：在这种情况下，单位可能根据内部规章制度或劳动合同约定处理工资问题。如果职工因伤需要治疗和休息而向用人单位请病假，单位可依据本单位依法制定的病假工资支付规定支付病假工资，该工资标准不得低于当地最低工资标准的80%。若职工未按规定请假而擅自缺勤，单位可按规章制度处理，但通常不会扣发工资至零，而是会给予一定的处理或支付病假工资。

3. 特殊情况与建议：

   • 交通事故赔偿与工伤待遇的并存：当职工同时面临交通事故赔偿和工伤待遇时，两者并不冲突，职工有权同时享受。但具体的赔偿标准和程序需遵循相关法律法规及地方规定。因此，即使获得了交通事故赔偿，职工仍可申请工伤认定并享受相应的工伤待遇。
   • 单位的责任与义务：不论是否认定为工伤，单位都应积极协助职工处理交通事故和工伤认定的相关事宜，确保职工的合法权益得到有效保障。如果单位未依法为职工缴纳工伤保险，那么所有赔偿责任将由单位承担。

行动建议：

• 如果您在上班途中发生了交通事故，请立即报警并保留好相关证据，如交通事故责任认定书、医疗证明等。
• 及时向单位报告事故情况，并申请工伤认定。如果单位未协助您申请工伤认定，您可以自行向当地社会保险行政部门提出申请。
• 在停工留薪期内，确保与单位保持沟通，了解工资发放情况，并保留好相关证据。
• 如果对工伤认定或工资发放有疑问或争议，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。