结论：迟到1分钟扣当月绩效百分之二十是否合法，需结合具体情况判断，但一般情况下，这种做法可能涉嫌违法。以下从不同角度进行分析：
一、从劳动合同和规章制度的角度
劳动合同约定：
- 如果劳动合同中明确规定了迟到扣绩效的具体条款，且该条款不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位按照合同约定执行是合法的。但即便如此，扣绩效的比例也应当合理，不能显失公平。迟到1分钟即扣当月绩效的百分之二十，这样的比例显然过高，可能被视为不合理。
规章制度规定：
- 用人单位的规章制度也是判断合法性的重要依据。规章制度应当经过民主程序制定，且内容合法、合理。如果规章制度中规定了迟到扣绩效的条款，但扣罚比例过高或缺乏合理性，那么该条款可能因违法或不合理而被认定为无效。
二、从法律法规的角度
《劳动法》和《劳动合同法》的相关规定：
- 根据《劳动法》和《劳动合同法》的相关规定，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。同时，用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。
- 如果用人单位未经民主程序制定规章制度，或者规章制度内容违法、不合理，那么该规章制度对劳动者不具有约束力。因此，迟到扣绩效的规定如果未经民主程序制定或内容违法、不合理，那么用人单位据此扣罚劳动者绩效是违法的。
扣罚比例的合理性：
- 即便规章制度或劳动合同中规定了迟到扣绩效的条款，扣罚比例也应当合理。迟到1分钟即扣当月绩效的百分之二十，这样的比例显然过高，不符合常理和公平原则。在司法实践中，法院或劳动仲裁机构可能会根据具体情况调整扣罚比例，以维护劳动者的合法权益。
三、建议与措施
与用人单位协商：
- 如果劳动者认为用人单位的扣罚规定不合理或违法，可以首先与用人单位进行协商，寻求合理的解决方案。
向劳动监察部门投诉：
- 如果协商无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉，请求劳动监察部门对用人单位的违法行为进行查处。
申请劳动仲裁或提起诉讼：
- 如果劳动监察部门未能解决问题，劳动者还可以向劳动仲裁机构申请劳动仲裁或向人民法院提起诉讼，维护自己的合法权益。
总结：迟到1分钟扣当月绩效百分之二十的做法，在一般情况下可能涉嫌违法。用人单位在制定规章制度或劳动合同条款时，应当遵循合法、合理、公平的原则，确保劳动者的合法权益不受侵害。如果劳动者遇到此类问题，可以积极与用人单位协商、向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁、提起诉讼等途径来维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。