结论：档案在破产单位但目前在国企工作，是否能按特殊工种退休，需结合具体情况判断，主要取决于是否满足特殊工种的工作年限要求以及档案材料的完整性。以下从不同角度详细分析：
一、特殊工种退休的基本条件
根据相关规定，特殊工种退休通常需满足以下条件：
从事特殊工种年限：一般要求从事高空、特别繁重体力劳动等特殊工种满10年；从事井下、高温等特殊工种满9年；从事其他有害身体健康工作满8年。这是判断能否按特殊工种退休的核心条件。
档案材料完整：个人档案中需有明确的从事特殊工种的记录，包括工种名称、工作时间、工作地点等，这是证明个人符合特殊工种退休条件的重要依据。
二、档案在破产单位的影响
档案材料完整性：如果破产单位在破产前已妥善保管了您的档案，且档案中完整记录了您从事特殊工种的相关信息，那么这通常不会影响您按特殊工种退休的申请。
档案转移与补办：如果破产单位在破产过程中档案丢失或损坏，您可能需要通过法律途径或相关行政部门要求破产单位或其上级主管部门协助补办或出具相关证明。在此过程中，国企作为您当前的工作单位，可能无法直接提供您在破产单位从事特殊工种的档案材料，但可以协助您与相关部门沟通。
三、国企工作的现状对退休的影响
当前工作性质：如果您在国企的工作不属于特殊工种，那么这部分工作年限通常不计入特殊工种退休的工作年限要求中。
国企的协助义务：国企作为您当前的工作单位，有义务协助您办理退休手续，包括提供您在国企工作期间的相关档案材料。但对于您在破产单位从事特殊工种的档案材料，国企可能无法直接提供。
四、建议与行动步骤
核实档案材料：首先，您需要核实个人档案中是否完整记录了从事特殊工种的相关信息。如果档案材料不完整或丢失，应尽快与破产单位或其上级主管部门联系，要求补办或出具相关证明。
咨询社保部门：在确认档案材料完整后，您可以咨询当地社保部门或人力资源和社会保障局，了解具体的特殊工种退休政策和申请流程。
准备申请材料：根据社保部门的要求，准备相关的申请材料，包括个人档案、身份证、户口本等。
提交申请并跟进：将准备好的申请材料提交给社保部门，并跟进审批进度。如有需要，及时补充或修改相关材料。
最后，档案在破产单位但目前在国企工作，是否能按特殊工种退休需结合具体情况判断。如果您在档案材料、工作年限等方面存在疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。