关于实习证明和毕业三方协议盖的不是同一个章是否可以的问题，这主要取决于具体的情况和规定，但一般情况下，实习证明和毕业三方协议上的章应该是同一单位或相关联单位的，以确保信息的真实性和一致性。
首先，我们来明确一下实习证明和毕业三方协议的作用和性质：
实习证明：这是由实习单位出具的，证明你在该单位实习过一段时间的文件。它通常包含实习的起止时间、实习岗位、实习内容以及实习单位对你的评价等信息。实习证明上的章应该是实习单位的公章或人事部门的章，以证明其真实性。
毕业三方协议：这是由学校、毕业生和用人单位三方共同签订的协议，用于明确毕业生在毕业后到用人单位工作的相关事宜。它通常包含毕业生的个人信息、用人单位的信息、工作岗位、薪资待遇、工作时间等关键条款。毕业三方协议上的章应该是用人单位的公章，以证明协议的合法性和有效性。
现在，我们回到问题本身。如果实习证明和毕业三方协议上的章不是同一个，那么可能会引发以下问题：
信息不一致：如果实习单位和用人单位不是同一个，那么实习证明和毕业三方协议上的信息可能存在不一致的情况，这可能会给学校或用人单位带来困惑或误解。
真实性存疑：如果实习证明和毕业三方协议上的章没有关联或无法验证其真实性，那么学校或用人单位可能会对这两份文件的真实性产生怀疑，从而影响你的毕业或就业。
因此，为了确保信息的真实性和一致性，以及避免不必要的麻烦和误解，建议实习证明和毕业三方协议上的章应该是同一单位或相关联单位的。如果确实存在特殊情况，比如实习单位和用人单位不是同一个，但两者之间有明确的合作关系或委托关系，并且能够提供相应的证明文件，那么也可以考虑接受这种情况。但无论如何，都应该确保所有文件的真实性和合法性，以维护自己的权益和声誉。