商铺在消防不合格的情况下进行营业，其处罚依据主要来源于《中华人民共和国消防法》的相关规定。以下是对此问题的详细分析：

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国消防法》第十五条：“公众聚集场所投入使用、营业前消防安全检查实行告知承诺管理。公众聚集场所在投入使用、营业前，建设单位或者使用单位应当向场所所在地的县级以上地方人民政府消防救援机构申请消防安全检查，作出场所符合消防技术标准和管理规定的承诺，提交规定的材料，并对其承诺和材料的真实性负责。…未经消防救援机构许可，擅自投入使用、营业的，或者经核查发现场所使用、营业情况与承诺内容不符的，依法责令停止施工、停止使用或者停产停业，并处三万元以上三十万元以下罚款。”
   • 同时，该法第六十条也规定了：“单位违反本法规定，有下列行为之一的，责令改正，处五千元以上五万元以下罚款：（一）消防设施、器材或者消防安全标志的配置、设置不符合国家标准、行业标准，或者未保持完好有效的；（二）损坏、挪用或者擅自拆除、停用消防设施、器材的；…（六）人员密集场所在门窗上设置影响逃生和灭火救援的障碍物的；（七）对火灾隐患经消防救援机构通知后不及时采取措施消除的。…有本条第一款第三项、第四项、第五项、第六项行为，经责令改正拒不改正的，强制执行，所需费用由违法行为人承担。”虽然此条未直接提及“消防不合格营业”，但消防不合格往往伴随着上述违法行为，且若经责令改正拒不改正，将面临更严厉的处罚。不过，更直接针对“消防不合格营业”的处罚，还是依据第十五条的相关规定。

2. 处罚措施：

   • 对于未经消防救援机构许可，擅自投入使用、营业的商铺，消防救援机构将依法责令其停止施工、停止使用或者停产停业。
   • 同时，还将对商铺处以三万元以上三十万元以下的罚款，具体罚款数额根据违法情节的严重程度、商铺的规模、可能造成的危害后果等因素综合确定。

3. 实际案例与操作：

   • 在实际操作中，消防救援机构会定期对商铺进行消防安全检查，一旦发现商铺存在消防不合格的情况，如消防设施缺失、损坏或不符合标准，消防通道被堵塞等，将立即下达整改通知书，要求商铺限期整改。
   • 如果商铺在规定期限内未完成整改或整改后仍不符合消防安全要求，消防救援机构将依法对其进行处罚，包括责令停业和罚款等。

4. 建议与提醒：

   • 作为商铺经营者，应严格遵守消防安全法律法规，确保商铺的消防设施完好有效，消防通道畅通无阻。
   • 在投入使用或营业前，应主动向当地消防救援机构申请消防安全检查，并按照要求提交相关材料和承诺。
   • 如遇到消防安全问题或需要法律帮助，可直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律意见和帮助。

综上所述，商铺在消防不合格的情况下进行营业，将面临责令停业和罚款等处罚措施。因此，商铺经营者应高度重视消防安全工作，确保商铺的消防安全符合法律法规要求。