若用人单位在包月工资制下，因过年放假扣除员工工资，该行为一般不合法，员工有权要求用人单位补发被扣工资。以下从不同角度为你详细分析：

从法律规定角度

根据《工资支付暂行规定》第十二条，非因劳动者原因造成单位停工、停产在一个工资支付周期内的，用人单位应按劳动合同规定的标准支付劳动者工资。过年放假通常属于非劳动者原因造成的停工，且一般在一个工资支付周期内（通常是一个月），所以用人单位应按照劳动合同约定的标准支付工资，不得随意扣除。

从劳动合同约定角度

1. 劳动合同有明确约定：如果劳动合同中明确约定了包月工资的计算方式以及在放假期间的工资支付标准，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位应按照合同约定执行。但如果合同约定违反了上述《工资支付暂行规定》，该约定无效，用人单位仍需按照法律规定支付工资。例如，合同约定过年放假期间工资按正常工资的50%支付，这就违反了法律规定，员工可以要求用人单位按正常工资标准补发。
2. 劳动合同无明确约定：在劳动合同没有明确约定放假期间工资支付标准的情况下，用人单位应遵循法律法规的规定，按照正常工资标准支付员工过年放假期间的工资。若用人单位扣除工资，员工可以与用人单位协商要求补发；协商不成的，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

应对措施

1. 与用人单位协商：员工可以先与用人单位的人力资源部门或相关负责人进行沟通，说明法律规定和自己的诉求，要求用人单位补发被扣除的工资。在协商过程中，要注意保留好相关的沟通记录，如聊天记录、邮件等。
2. 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，员工可以向当地的劳动监察部门投诉。劳动监察部门会依法对用人单位进行检查，并责令用人单位改正违法行为，补发员工工资。投诉时，员工需要提供相关的证据，如劳动合同、工资条、考勤记录等，以证明用人单位存在扣工资的行为。
3. 申请劳动仲裁：员工还可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。劳动仲裁是解决劳动争议的一种有效方式，仲裁委员会会根据双方提供的证据和法律规定进行裁决。如果员工对仲裁裁决不服，还可以向人民法院提起诉讼。

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