民间借贷证据不齐全时，法院仍会受理案件，但能否胜诉取决于证据能否形成完整链条以支持诉讼请求。具体分析如下：

1. 立案标准与证据要求
   根据《民事诉讼法》第122条，立案仅需满足“有明确的被告、具体的诉讼请求和事实理由”等基本条件，不要求证据必须完整。即使借条丢失、转账记录不全，只要原告能提供初步证据（如聊天记录、证人证言等）表明纠纷存在，法院就会立案。但需注意：

   • 若完全无任何证据（如既无借条也无转账记录），可能因“事实理由不具体”被驳回起诉；
     
   • 立案后，若被告抗辩且原告无法补强证据，可能面临败诉风险。

2. 证据不齐全时的补救措施
   若关键证据缺失，可通过以下方式补救：

   • 申请法院调查取证：如银行流水、微信/支付宝转账记录等，可申请法院向第三方机构调取；
     
   • 补充间接证据：通过录音、短信、邮件等证明借贷合意，或通过证人证言佐证资金交付事实；
     
   • 利用举证责任分配：若被告主张款项为赠与、投资等，需由被告承担举证责任，原告可借此反推借贷关系。

3. 实务建议

   • 立案阶段：优先提交所有现有证据（包括不完整的借条、部分转账记录等），并附书面说明解释证据缺失原因；
     
   • 诉讼阶段：积极通过律师调查令、申请证人出庭等方式完善证据链，避免因证据不足被驳回；
     
   • 风险提示：若证据无法证明“借贷合意+资金交付”两个核心要件，即使立案也可能败诉，需提前评估风险。

总结：证据不齐全不影响立案，但直接影响诉讼结果。建议根据现有证据情况，制定针对性诉讼策略，必要时委托律师协助取证和庭审辩护。如有具体案件细节，可进一步向我咨询。