存在犯罪事实但仍然存疑不起诉，这主要是基于“疑罪从无”的刑事司法原则。以下从多个角度为你详细解释这一现象：

1. 证据不足：

   • 在刑事案件中，指控一个人犯罪需要达到“证据确实、充分”的标准。这包括证据的真实性、合法性和关联性，以及证据之间能够形成完整的证据链，排除合理怀疑。
   • 如果尽管存在犯罪事实，但证据不足以证明犯罪嫌疑人就是实施该犯罪行为的人，或者证据之间存在矛盾，无法形成完整的证据链，那么根据“疑罪从无”的原则，检察机关可能会作出存疑不起诉的决定。

2. 法律程序要求：

   • 刑事诉讼程序有着严格的法律要求，包括证据的收集、审查、判断等各个环节。如果在这个过程中发现证据存在问题，或者无法满足法律规定的证明标准，那么就不能对犯罪嫌疑人进行定罪处罚。
   • 存疑不起诉是检察机关在审查起诉阶段，对案件证据进行全面审查后，认为证据不足、不符合起诉条件而作出的决定。这是法律程序公正性的体现，也是保障犯罪嫌疑人合法权益的重要措施。

3. 保护犯罪嫌疑人权益：

   • 在刑事诉讼中，犯罪嫌疑人享有诸多合法权益，如辩护权、沉默权等。存疑不起诉的决定，也是对这些权益的一种保护。
   • 如果因为证据不足而错误地对犯罪嫌疑人进行定罪处罚，那么将严重侵犯其合法权益，造成不可挽回的损失。因此，在证据不足的情况下，选择存疑不起诉是更为谨慎和合理的做法。

4. 司法实践中的考量：

   • 在司法实践中，检察机关在作出存疑不起诉决定时，会综合考虑多种因素，如案件的性质、情节、社会影响等。
   • 如果案件涉及重大社会利益或公共安全，检察机关可能会更加谨慎地处理，确保在证据充分、确实的情况下才提起公诉。

举例说明： 假设有一个盗窃案件，现场留下了嫌疑人的指纹和脚印，但这些证据并不足以直接证明嫌疑人就是实施盗窃的人。因为指纹和脚印可能是在其他时间、其他情况下留下的，与盗窃行为没有直接关联。在这种情况下，尽管存在犯罪事实（即盗窃行为），但由于证据不足，检察机关可能会作出存疑不起诉的决定。

建议：

• 如果你或你身边的人遇到了类似的情况，不要惊慌失措。首先，要了解自己的合法权益，包括辩护权、沉默权等。
• 其次，要积极配合司法机关的调查工作，提供有利于自己的证据和信息。
• 最后，如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供专业的法律建议。