公司与县政府签订的投资协议，在符合法律规定和程序要求的情况下，通常是有效的。不过，投资协议的有效性会受到多种因素的影响，以下从不同角度为你详细分析：

一、协议主体资格

1. 公司方面：公司作为法人实体，具有签订合同和进行投资活动的法律资格。只要公司依法设立并有效存续，就具备签订投资协议的主体资格。
2. 县政府方面：县政府作为行政机关，在行使职权、管理公共事务的过程中，也有权签订投资协议。但需要注意的是，县政府签订投资协议应当在其职权范围内，并且符合相关法律法规的规定。如果县政府超越职权或者违反法定程序签订投资协议，可能会影响协议的效力。

二、协议内容合法性

1. 符合法律法规：投资协议的内容必须符合国家法律法规的规定，不得违反法律、行政法规的强制性规定。例如，协议中不得包含非法集资、欺诈等违法内容。
2. 不损害公共利益：投资协议的内容不得损害国家利益、社会公共利益和他人合法权益。如果协议内容涉及公共利益，如土地使用、环境保护等，应当符合相关法律法规和政策要求。

三、协议签订程序

1. 合法程序：投资协议的签订应当遵循合法程序，包括协商、起草、审查、签订等环节。特别是涉及重大投资项目或者需要政府审批的项目，应当按照相关规定履行审批手续。
2. 公开透明：在签订投资协议的过程中，应当保持公开透明，确保双方当事人的知情权、参与权和监督权。这有助于增强协议的合法性和有效性。

四、可能影响协议效力的其他因素

1. 意思表示真实：双方当事人在签订投资协议时，应当意思表示真实，不存在欺诈、胁迫等情形。如果一方当事人以欺诈、胁迫等手段使对方在违背真实意思的情况下签订协议，受损害方有权请求人民法院或者仲裁机构变更或者撤销协议。
2. 协议形式合规：根据法律法规的规定，某些类型的合同可能需要采用书面形式或者其他特定形式。如果投资协议属于这类合同，而双方当事人未采用规定的形式，可能会影响协议的效力。不过，在大多数情况下，投资协议采用书面形式即可满足法律要求。

五、法律建议

1. 在签订投资协议前，公司应当对县政府的职权范围、相关法律法规和政策要求进行充分了解，确保协议内容合法合规。
2. 在协议签订过程中，公司应当保持谨慎态度，对协议条款进行仔细审查，确保双方当事人的权利义务明确、具体。
3. 如果发生争议，公司应当及时寻求法律援助，通过合法途径维护自身权益。

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