结论：个人与公司签订的合伙协议中约定“合伙人签字盖章后生效”，但公司只有法人签字而未盖章，该协议的效力需分情况讨论。

分析：

1. 协议生效条件的一般规定：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。在签名、盖章或者按指印之前，当事人一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同成立。
   • 对于合伙协议，若双方明确约定“签字盖章后生效”，则通常理解为需要双方签字并盖章后协议才生效。但这一约定并非绝对，还需结合实际情况和法律规定进行综合判断。

2. 公司法人签字效力：

   • 公司法人作为公司的法定代表人，其签字在法律上通常代表公司的意志。若法人签字是在其职权范围内，且没有违反公司章程或相关法律法规的规定，则其签字具有法律效力。
   • 在合伙协议中，若公司法人签字代表了公司对协议内容的认可，且该签字行为符合公司章程或相关法律法规的规定，那么即使公司未盖章，该协议也可能因法人的有效签字而成立并生效。但这一判断需结合具体案情和证据进行。

3. 未盖章可能的影响：

   • 若合伙协议中明确约定了“签字盖章后生效”，而公司未盖章，这可能构成对协议生效条件的未完全履行。然而，这并不意味着协议绝对无效。
   • 在实践中，如果双方已经实际履行了合伙协议中的部分或全部义务，且对方未提出异议，那么该协议可能因实际履行而被视为有效。此外，如果公司事后追认了该协议（如通过盖章、出具书面确认函等方式），则协议的效力也将得到补正。

4. 建议措施：

   • 与公司沟通：首先，建议与对方公司沟通，了解其未盖章的具体原因，并协商解决方案。如果公司愿意盖章或出具书面确认函，则问题将得到妥善解决。
   • 收集证据：如果沟通无果，建议收集相关证据（如法人签字、实际履行情况等），以证明协议的实际成立和生效。这些证据将在后续可能的法律纠纷中发挥重要作用。
   • 寻求法律救济：如果双方无法就协议效力达成一致，且因此产生了法律纠纷，建议及时寻求法律救济。可以向法院提起诉讼或申请仲裁，要求确认协议的效力或解决相关争议。

后续行动建议：

• 在处理此类问题时，务必保持谨慎和理性。不要因为对方未盖章而轻易认为协议无效，也不要忽视实际履行情况对协议效力的影响。
• 如果对协议效力存在疑问或担忧，建议及时咨询专业律师（即我，杨毅律师），以便获得更具体和专业的法律建议。

总结：个人与公司签订的合伙协议中约定“合伙人签字盖章后生效”，但公司只有法人签字而未盖章时，协议的效力需结合实际情况和法律规定进行综合判断。建议与公司沟通、收集证据，并在必要时寻求法律救济。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。