结论：面对单位以证据只保留了两年为由，要求劳动者举证两年前年休假工资的情况，劳动者可以从多个角度进行应对和主张权益。以下是一些具体的分析和建议：

1. 法律规定的举证责任：

   • 根据《劳动争议调解仲裁法》第六条：“发生劳动争议，当事人对自己提出的主张，有责任提供证据。与争议事项有关的证据属于用人单位掌握管理的，用人单位应当提供；用人单位不提供的，应当承担不利后果。”这意味着，在劳动争议中，虽然劳动者有责任提供证据支持自己的主张，但如果相关证据由用人单位掌握管理，如考勤记录、工资发放记录等，那么用人单位有义务提供这些证据。若用人单位无法提供，则可能面临不利后果。
   • 对于年休假工资的主张，如果单位无法提供劳动者已享受年休假或已支付年休假工资的证据，那么单位可能需要承担举证不能的责任。

2. 劳动者可采取的行动：

   • 收集间接证据：尽管直接证据可能难以获取，但劳动者可以尝试收集间接证据来支持自己的主张。例如，可以收集同事的证言、工作安排记录、电子邮件或聊天记录等，这些证据可能间接证明劳动者未享受年休假或未获得年休假工资。
   • 向劳动监察部门投诉：劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉单位的违法行为。劳动监察部门有权对单位进行调查，并要求单位提供相关证据。如果单位无法提供，劳动监察部门可能会对单位进行处罚，并帮助劳动者追回年休假工资。
   • 申请劳动仲裁或提起诉讼：如果劳动者与单位无法就年休假工资问题达成一致，劳动者可以向劳动仲裁机构申请仲裁或向法院提起诉讼。在仲裁或诉讼过程中，劳动者需要提供尽可能多的证据来支持自己的主张。如果单位无法提供反驳证据，那么劳动者可能获得胜诉。

3. 关于证据保留期限的说明：

   • 虽然单位可能声称证据只保留了两年，但这并不意味着劳动者就无法主张两年前的年休假工资。因为根据法律规定，用人单位有义务长期保存与劳动者权益相关的证据，如考勤记录、工资发放记录等。如果单位确实无法提供这些证据，那么单位可能需要承担举证不能的责任。
   • 此外，劳动者也可以尝试通过其他途径获取相关证据，如向银行查询工资发放记录、向社保部门查询社保缴纳记录等。这些记录可能间接证明劳动者的工资收入和休假情况。

4. 建议与注意事项：

   • 及时主张权益：劳动者在发现单位未支付年休假工资或未安排年休假时，应及时向单位提出异议并主张权益。避免因为拖延时间过长而导致证据丢失或难以获取。
   • 保留相关证据：劳动者在日常工作中应注意保留与年休假相关的证据，如考勤记录、工作安排记录、请假条等。这些证据在主张权益时可能起到关键作用。
   • 咨询专业律师：如果劳动者在主张年休假工资过程中遇到困难或疑问，可以向我咨询。我会根据具体情况为劳动者提供专业的法律建议和帮助。

总结：面对单位以证据只保留了两年为由要求劳动者举证两年前年休假工资的情况，劳动者可以从法律规定的举证责任、收集间接证据、向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼等多个角度进行应对和主张权益。同时，劳动者也应注意及时主张权益、保留相关证据，并在必要时咨询专业律师以获取更专业的帮助。