结论前置：是否需要仲裁取决于还款协议的履行情况以及协议内容是否合法有效。若协议能顺利履行，则无需仲裁；若协议无法履行或存在争议，则仍需通过仲裁等法律途径解决。以下从不同角度详细分析：
一、还款协议履行顺利的情况
如果双方签订了拖欠工资的还款协议，并且用人单位能够按照协议约定的时间和金额，及时、足额地支付拖欠的工资，那么这份还款协议就起到了它应有的作用，此时无需再通过仲裁等法律途径来解决拖欠工资的问题。因为仲裁等法律途径通常是在双方无法协商一致，或者一方不履行协议等情况下，为了维护自身合法权益而采取的措施。既然协议已经得到了顺利履行，那么就没有必要再启动这些法律程序了。
二、还款协议无法履行或存在争议的情况
用人单位不履行还款协议：如果用人单位在签订还款协议后，仍然不按照协议约定的时间和金额支付拖欠的工资，那么劳动者就有权根据协议内容，向劳动仲裁机构申请仲裁，要求用人单位支付拖欠的工资以及可能产生的违约金等。在这种情况下，还款协议不仅不能替代仲裁，反而成为了劳动者申请仲裁的重要依据。
还款协议内容存在争议：有时候，双方在签订还款协议时，可能由于各种原因（如沟通不畅、理解偏差等），导致协议内容存在模糊不清或者存在争议的地方。比如，协议中可能没有明确约定支付工资的具体时间、金额或者支付方式等。在这种情况下，如果双方无法就协议内容达成一致意见，那么劳动者仍然有权向劳动仲裁机构申请仲裁，要求对协议内容进行解释或者确认。此时，仲裁就成为了解决争议、维护劳动者合法权益的重要途径。
还款协议存在违法情形：如果还款协议的内容违反了法律法规的强制性规定（比如约定了过低的违约金、免除了用人单位的法定责任等），那么这份协议就可能是无效的。在这种情况下，劳动者不仅有权拒绝履行协议，还有权根据法律法规的规定，向劳动仲裁机构申请仲裁，要求用人单位支付拖欠的工资以及承担相应的法律责任。此时，仲裁就成为了纠正违法行为、维护劳动者合法权益的必要手段。
建议：在签订还款协议时，劳动者应当仔细阅读协议内容，确保协议内容合法、明确、无歧义，并且要求用人单位在协议上签字盖章确认。同时，劳动者还应当保留好与用人单位签订的所有书面材料（包括还款协议、工资条、考勤记录等），以便在需要时作为证据使用。如果遇到用人单位不履行还款协议或者协议内容存在争议的情况，劳动者应当及时向劳动仲裁机构申请仲裁，以维护自己的合法权益。
最后，如果你在劳动纠纷方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会尽我所能为你提供专业的法律服务。