结论前置：即使您与公司就拖欠工资问题签订了协议，您仍然有权申请劳动仲裁，但仲裁结果会根据您的具体诉求和协议内容而有所不同。以下是对此问题的详细分析：

1. 协议内容对仲裁的影响

   • 若协议已解决拖欠工资问题：如果协议中明确约定了公司支付拖欠工资的具体时间、金额及方式，并且公司已按照协议履行完毕，那么您再以拖欠工资为由申请仲裁，要求支付工资的请求可能不会得到支持。因为此时争议事项已经通过协议得到解决，不存在进一步的支付义务。
   • 若协议未完全解决争议：如果协议仅涉及部分拖欠工资的支付，或者协议中存在其他争议条款（如经济补偿、赔偿金等未达成一致），您仍然可以就未解决的部分或新的争议点申请劳动仲裁。

2. 可仲裁的诉求及法律依据

   • 经济补偿：根据《劳动合同法》的规定，若公司未及时足额支付劳动报酬，您有权解除劳动合同，并要求公司支付经济补偿。经济补偿的标准按您在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。即使签订了协议，若协议未涉及经济补偿或您认为补偿不合理，您仍可就此申请仲裁。
   • 加付赔偿金：若劳动行政部门曾责令公司限期支付劳动报酬而公司逾期未支付，根据《劳动合同法》的规定，公司需按应付金额的百分之五十至百分之一百向您加付赔偿金。若协议未涉及此部分赔偿或您认为赔偿不足，您同样可以申请仲裁要求加付。

3. 仲裁前的准备与建议

   • 收集证据：在提起仲裁前，您应尽可能收集与公司拖欠工资及协议相关的所有证据，如工资条、银行流水、劳动合同、协议文本、劳动行政部门的责令支付通知等。这些证据将有助于支持您的仲裁请求。
   • 及时咨询与提起仲裁：遇到公司拖欠工资或协议履行问题，您应及时向当地的劳动争议仲裁委员会咨询，并在仲裁时效内提起仲裁。劳动仲裁的时效期间为一年，从您知道或者应当知道权利被侵害之日起计算。

综合建议：签订协议并不意味着您放弃了所有仲裁权利。若协议未完全解决您的诉求或您认为协议内容不公平、不合理，您仍然有权申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在提起仲裁前，请务必做好充分的准备，包括收集证据、了解相关法律法规等。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。