市场监管从立案到作出处罚决定的期限90日，指的是自然日，而非工作日。以下是对这一问题的详细分析：

法律依据与解释

根据《市场监督管理行政处罚程序规定》的相关规定，市场监督管理部门在立案后，一般应当在九十日内作出行政处罚决定。这里的“九十日”明确指的是自然日，即从立案之日起连续计算的九十天，包括工作日和休息日、节假日等。这一规定旨在确保行政处罚的及时性和效率性，防止案件久拖不决。

特殊情况下的期限延长

虽然一般期限为九十日，但在某些特殊情况下，如案件情况复杂、需要进一步调查取证等，市场监督管理部门可以报经上一级市场监督管理部门批准，延长办案期限。然而，这种延长并非无限制，且需要遵循严格的审批程序。

实际操作中的注意事项

1. 及时立案与调查：市场监督管理部门在接到投诉举报或发现违法行为后，应及时立案并展开调查，以确保在法定期限内作出处罚决定。
2. 证据收集与保全：在调查过程中，应注重证据的收集与保全，确保案件事实清楚、证据确凿。
3. 程序合法性：在作出处罚决定前，应确保所有程序均符合法律规定，如告知当事人陈述、申辩权利，听取当事人意见等。
4. 期限计算与监督：市场监督管理部门应准确计算办案期限，并在期限届满前作出处罚决定或采取其他合法措施。同时，上级部门也应加强对下级部门办案期限的监督，确保案件及时处理。

法律后果

如果市场监督管理部门未在法定期限内作出处罚决定，且未依法延长办案期限，则可能构成程序违法。在这种情况下，当事人有权依法申请行政复议或提起行政诉讼，要求撤销或变更原处罚决定。

总结与建议：市场监管从立案到作出处罚决定的期限90日是自然日。市场监督管理部门应严格遵守这一期限规定，确保案件及时、公正处理。如果您在市场监管领域遇到任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问，我将竭诚为您提供专业、全面的法律服务。