在解答您关于《市场监督管理行政处罚程序规定》中“90日”是否为工作日的问题时，我们可以明确以下几点：

首先，根据《行政处罚法》及其相关行政法规的一般原则，除非法律条文特别指明为“工作日”，否则所提及的日期，如“90日”，应理解为自然日。这包括了周末和法定节假日，旨在确保行政效率，避免因节假日或休息日而延误案件处理。

其次，具体到《市场监督管理行政处罚程序规定》，该规定明确指出，市场监督管理部门办理行政处罚案件的期限自立案之日起计算，应当自立案之日起九十日内作出处理决定。这里的“九十日”同样被解释为包含法定节假日的自然日，这体现了提高行政效率、及时处理案件的原则。

此外，虽然一般情况下“90日”指的是自然日，但在具体法律条文中，如果明确规定了某期限是“工作日”，则应按照工作日来计算。不过，在《市场监督管理行政处罚程序规定》中，并未将“90日”特别指明为工作日。

最后，需要提醒的是，案件处理过程中，中止、听证、公告或检测、检验、检疫、鉴定等时间是不计入案件办理期限的。同时，如果因案情复杂或其他原因不能在规定期限内作出处理决定，经市场监督管理部门负责人批准，可以延长30日。案情特别复杂或有其他特殊情况的，还可以进一步延期，但需由市场监督管理部门负责人集体讨论决定。

综上所述，在《市场监督管理行政处罚程序规定》中，“90日”指的是自然日，而非工作日。希望这一解答能够清晰、详细地解答您的疑问。