农用地挖地下室，一般由县级以上人民政府自然资源主管部门负责查处。以下是对此问题的详细分析：

法律依据与查处主体

根据《中华人民共和国土地管理法》的相关规定，农用地是指直接用于农业生产的土地，包括耕地、林地、草地、农田水利用地、养殖水面等。在农用地上挖地下室，若未经合法批准，擅自改变了土地用途，属于违法行为。对于此类违法行为，县级以上人民政府自然资源主管部门有权进行查处，包括责令限期改正、没收违法所得、罚款等行政处罚措施。

查处流程与可能后果

1. 发现违法行为：自然资源主管部门或相关执法机构在巡查、举报或其他途径中发现农用地挖地下室的违法行为。
2. 立案调查：对违法行为进行立案，并展开调查，收集相关证据，如现场照片、询问笔录、土地利用现状图等。
3. 作出处罚决定：根据调查结果，自然资源主管部门将依法作出处罚决定，如责令限期改正、恢复土地原状、罚款等。若违法行为严重，还可能涉及刑事责任。
4. 执行处罚决定：被处罚人需在规定期限内履行处罚决定，如逾期不履行，自然资源主管部门可申请人民法院强制执行。

特殊情况与注意事项

1. 若涉及基本农田：基本农田是受到严格保护的农用地，若在基本农田上挖地下室，将面临更严厉的处罚。根据《基本农田保护条例》的规定，破坏基本农田的，除责令限期改正、恢复原状外，还可能面临高额罚款，甚至刑事责任。
2. 若已取得合法手续：若挖地下室的行为已经取得了合法的土地使用手续和建设规划许可，则不属于违法行为，无需接受查处。但需确保施工过程中的安全和质量，遵守相关法律法规和规定。
3. 举报与投诉：若发现有人在农用地上非法挖地下室，可向当地自然资源主管部门或相关执法机构进行举报和投诉。举报时需提供详细的违法线索和证据，以便执法机构及时查处。

建议与提醒

• 遵守法律法规：在农用地上进行任何建设活动，都需严格遵守相关法律法规和规定，确保土地用途的合法性和合规性。
• 咨询专业意见：在进行农用地建设活动前，建议咨询专业律师或相关部门的意见，了解相关法律法规和政策要求，避免违法行为的发生。
• 保护土地资源：土地资源是宝贵的自然资源，需得到妥善保护和合理利用。任何破坏土地资源的行为都将受到法律的制裁。

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