农业用地以租代征为住房用地是不合法的行为。以下是对此问题的详细解答：
一、法律依据与违规实质
直接法律禁止及处罚规定：
- 根据《中华人民共和国土地管理法》第八十二条，擅自将农民集体所有的土地通过出让、转让使用权或者出租等方式用于非农业建设，是明确禁止的，并会受到县级以上人民政府自然资源主管部门的严厉处罚，包括责令限期改正、没收违法所得，并处罚款。
- 同时，《土地管理法》第六十三条也严格限制了集体经营性建设用地的使用方式，规定只有符合特定条件（如土地利用总体规划、城乡规划确定为工业、商业等经营性用途，并经依法登记）的集体经营性建设用地，才能通过出让、出租等方式交由单位或者个人使用，且需履行一系列法定程序。而“以租代征”往往未履行这些程序。
违反土地用途管制：
- 我国土地分为农用地、建设用地和未利用地，并严格限制农用地转为建设用地，对耕地实行特殊保护。“以租代征”通常是将农用地，尤其是耕地，通过租赁方式实际用于非农业建设，擅自改变了土地用途，规避了农用地转用审批等法定程序。
违反集体土地征收程序：
- 集体土地征收需遵循严格的法定程序，包括发布征收土地预公告、开展土地现状调查、社会稳定风险评估、拟定征地补偿安置方案并公告、组织听证、签订征地补偿安置协议、申请土地征收审批等环节。“以租代征”绕过了这些法定征收程序，剥夺了农民的知情权、参与权和获得合理补偿的权益。
二、“以租代征”的危害
损害农民利益：
- “以租代征”给予的租金补偿通常低于正常征收土地时的补偿标准，且租金支付存在不确定性，如拖欠、停付等风险，导致农民失去土地后长远生计难以保障。
扰乱土地管理秩序：
- 这种行为破坏了正常的土地供应市场和管理秩序，使得不符合土地利用总体规划和产业政策的项目得以违规建设，影响土地资源的合理配置和可持续利用。
影响国家宏观调控：
- “以租代征”规避了国家的土地调控政策，可能导致土地市场的混乱，进而影响国家对经济社会的整体调控效果。
三、合法租赁与“以租代征”的区别
- 实践中，存在名为租赁农村土地，但实际上符合土地利用规划和相关规定，通过合法租赁程序用于农业生产经营活动的情况。
- 合法的农村土地租赁应满足以下条件：若涉及集体经营性建设用地，需符合土地利用总体规划、城乡规划确定的经营性用途并已依法登记；租赁程序合法合规，符合土地利用规划和相关法律法规；保障农民的土地权益和收益。
四、相关政策与禁令及法律责任
- 国家出台了相关政策与禁令，明确禁止“以租代征”等方式租用农民的土地进行非农建设，擅自改变耕地性质或用地规模。
- 一旦发现“以租代征”行为，相关部门将依据《土地管理法》等规定依法予以查处和纠正，责令恢复土地原状，没收违法所得，并处罚款，同时对相关责任人员进行处罚。
总结：农业用地以租代征为住房用地是不合法的行为，它违反了我国土地管理法的相关规定，损害了农民的土地权益，并扰乱了正常的土地管理秩序。因此，应坚决制止和纠正这一行为，维护土地市场的健康发展和农民群众的合法权益。如果您或他人遇到此类情况，建议及时向相关部门举报并寻求法律帮助。