公司强制员工从事违法行为，员工有权拒绝并可通过法律途径维护自身权益，具体处理方式如下：

1. 明确拒绝并保留证据
   若公司以明示或暗示方式要求员工从事违法行为（如财务造假、偷税漏税、侵犯知识产权等），员工应第一时间明确拒绝，并通过书面形式（邮件、微信等）留存拒绝的记录。若公司以威胁、降薪、解雇等手段强迫，需同步保存相关证据（如录音、聊天记录、书面通知等），这是后续维权的关键。

2. 向监管部门举报
   根据违法行为类型，员工可向对应部门举报：

   • 涉及税务违法：向当地税务局举报；
     
   • 涉及环境污染：向生态环境局举报；
     
   • 涉及安全生产：向应急管理局举报；
     
   • 涉及市场欺诈：向市场监督管理局举报。
     举报时需提供具体证据（如公司指令、操作流程、涉及金额等），监管部门调查后，若查实公司违法，会依法处罚，员工举报行为受法律保护，公司不得报复。

3. 以“被迫解除劳动合同”主张赔偿
   若公司以不从事违法工作即解雇相逼，员工可依据《劳动合同法》第38条，以“公司强迫违法”为由书面通知解除劳动合同，并要求公司支付经济补偿金（按工作年限，每满1年支付1个月工资）。若公司未支付，可申请劳动仲裁，仲裁时需提交公司强迫违法的证据及解除通知记录。

4. 报警或提起刑事控告（若涉及犯罪）
   若公司行为已构成犯罪（如诈骗、非法经营、走私等），员工可直接向公安机关报案。根据《刑事诉讼法》，员工作为知情人有义务配合调查，若公司因此被追究刑事责任，员工可主张自己是被胁迫参与，依法可从轻或减轻处罚，甚至免除处罚。

5. 注意自身安全与法律边界
   处理过程中需避免与公司发生直接冲突，若担心人身安全，可向警方申请保护。同时，员工需确保自身行为合法，例如：若公司要求伪造文件，员工不仅需拒绝，还需避免参与任何辅助行为（如提供个人信息、签字等），否则可能被认定为共犯。

总结：公司强制违法时，员工的核心原则是“拒绝+取证+维权”，既保护自身合法权益，也避免因参与违法被牵连。若具体情境复杂（如涉及高管责任、跨境违法等），可进一步向我说明细节，我会结合法律条文与实务案例为你分析。