农民工工资通常由施工总承包单位代发。这一规定主要基于《保障农民工工资支付条例》的相关要求，旨在保障农民工能够按时足额获得工资，减少工资拖欠现象。以下是对这一问题的详细解答：

一、法律依据

根据《保障农民工工资支付条例》第三十一条的规定，在工程建设领域推行分包单位农民工工资委托施工总承包单位代发制度。这意味着，在工程建设项目中，分包单位需要按月考核农民工的工作量，并编制工资支付表，经农民工本人签字确认后，与当月工程进度等情况一并交给施工总承包单位。施工总承包单位则根据分包单位编制的工资支付表，通过农民工工资专用账户直接将工资支付到农民工本人的银行账户，并向分包单位提供代发工资凭证。

二、代发流程

1. 设立专用账户：施工总承包单位需要在工程项目所在地银行开设“农民工工资专用账户”，该账户专款专用，仅用于支付该项目农民工的工资。
2. 编制与提交工资支付表：分包单位按月考核农民工的工作量，并编制工资支付表，包括农民工的姓名、身份证号、工作天数、应发工资等信息。该表需经农民工本人签字确认后，连同当月工程进度情况一并提交给施工总承包单位。
3. 审核与代发工资：施工总承包单位对分包单位提交的工资支付表进行审核，确认无误后，通过农民工工资专用账户将工资直接支付到农民工本人的银行账户。同时，向分包单位提供代发工资凭证，详细记录工资发放的明细。

三、各方责任

1. 分包单位责任：

   • 负责准确核算农民工的工作量和工资，确保提供的工资支付表真实、完整。
   • 对所招用农民工的实名制管理和工资支付负直接责任。
   • 若因提供虚假信息导致工资发放问题，需承担相应法律责任。

2. 施工总承包单位责任：

   • 对所承包工程项目的农民工工资支付负总责，监督分包单位按时足额提供工资支付信息。
   • 确保农民工工资专用账户资金充足，及时、足额代发工资。
   • 若分包单位拖欠农民工工资，施工总承包单位需先行清偿，并有权依法进行追偿。

四、实际意义

这一代发制度对农民工和建筑行业都具有重要意义：

1. 对农民工：减少了工资发放的中间环节，降低了被拖欠工资的风险，确保了农民工能够及时、足额收到工资，保障了其基本生活和合法权益。
2. 对建筑行业：有助于规范建筑市场秩序，减少因工资纠纷引发的社会不稳定因素，提升建筑行业的整体形象和信誉，促进建筑行业的健康、可持续发展。

五、特殊情况说明

虽然施工总承包单位是农民工工资代发的主要责任主体，但在某些特殊情况下，如分包单位具有独立法人资格且财务独立时，分包单位也可能直接支付农民工工资。然而，在这种情况下，分包单位仍需遵守相关法律法规，确保农民工工资的按时足额支付，并接受施工总承包单位的监督。

总结：农民工工资通常由施工总承包单位代发，这是基于《保障农民工工资支付条例》的明确规定。这一制度有助于保障农民工的合法权益，促进建筑行业的健康发展。如果您在农民工工资支付方面遇到任何问题或纠纷，欢迎随时向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。