结论：公司资质升级使用员工的资质，员工是否有责任需分情况讨论，主要取决于员工是否知情、是否参与以及公司使用资质的具体方式等因素。
详细分析：
员工不知情且未参与的情况：
- 如果员工完全不知情公司使用其资质进行资质升级，且没有以任何形式参与或协助公司这一行为，那么员工通常不承担责任。因为员工没有主观故意，也没有实施任何违法行为。
- 法律依据：根据一般法律原则，责任承担需以过错为基础，无过错则无责任。在此情况下，员工无过错，故不承担责任。
员工知情但未直接参与的情况：
- 如果员工知道公司使用其资质进行资质升级，但并未直接参与或协助，且没有从中获得不当利益，员工的责任可能相对较轻或没有。然而，如果员工在知情后未采取任何措施阻止或报告，可能在一定程度上构成对违法行为的默许，但通常不直接导致法律责任。
- 特殊情况：若员工有义务报告此类违法行为（如作为公司高管或特定岗位员工），则可能因未履行报告义务而承担一定责任。
员工知情且直接参与的情况：
- 如果员工不仅知情，还直接参与或协助公司使用其资质进行资质升级，那么员工将可能承担法律责任。这包括但不限于行政责任（如罚款、吊销资质等）和民事责任（如赔偿损失）。
- 法律依据：根据相关法律法规，如《中华人民共和国建筑法》、《中华人民共和国行政许可法》等，使用虚假资质或冒用他人资质进行资质升级是违法行为，参与者需承担相应法律责任。
员工从中获得不当利益的情况：
- 如果员工因公司使用其资质进行资质升级而获得了不当利益（如金钱、职位晋升等），那么员工不仅可能承担上述法律责任，还可能因受贿、贪污等违法行为而面临更严重的刑事责任。
- 法律依据：根据《中华人民共和国刑法》等相关规定，受贿、贪污等行为是犯罪行为，需承担刑事责任。
建议与后果：
- 对员工：如果员工发现自己资质被公司冒用，应立即与公司沟通并要求停止使用，同时保留相关证据以备不时之需。如果公司拒绝停止或员工因此遭受损失，员工可以向相关部门投诉或寻求法律援助。
- 对公司：公司应严格遵守相关法律法规，不得冒用员工资质进行资质升级。否则，公司将面临行政处罚、民事赔偿甚至刑事责任等严重后果。
进一步思考：
- 在实际操作中，员工应定期查询自己的资质使用情况，确保没有被公司冒用。
- 公司应建立完善的资质管理制度，明确资质使用的范围和程序，避免违法违规行为的发生。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。