针对“公司资质不全员工怎么处理”的问题，这主要涉及到员工在面临公司资质问题时的权益保障和应对措施。以下是对此问题的详细解答：
一、了解公司资质不全的法律后果
首先，员工需要明确公司资质不全可能带来的法律后果。根据相关法律法规，如《劳动合同法》等，不具备合法经营资格的用人单位需要承担法律责任。这包括但不限于向劳动者支付劳动报酬、经济补偿、赔偿金等。如果公司因资质问题被依法追究，员工有权要求公司或其出资人按照法律规定支付相应的款项。
二、保障自身权益
确认劳动关系：员工应确保与公司签订了正式的劳动合同，并妥善保管好合同原件。如果未签订劳动合同，应尽快与公司协商补签，以明确双方的劳动关系和权利义务。
保留证据：员工在平时工作中应注意固定、搜集和保留相关证据材料，如劳动合同、考勤记录、工资发放记录、工作安排等。这些证据在维权时将起到关键作用。
了解维权途径：员工应了解并熟悉维权途径，包括与公司协商、向调解组织申请调解、向劳动保障监察机构投诉、申请劳动仲裁或诉讼等。在必要时，可以向各级工会寻求支持与帮助。
三、应对公司资质不全的具体措施
与公司沟通：员工可以首先与公司进行沟通，了解公司资质不全的具体情况和原因，以及公司计划采取的补救措施。同时，员工可以表达自己的关切和诉求，与公司协商解决方案。
寻求法律援助：如果公司无法提供满意的解决方案，员工可以寻求法律援助，通过法律途径来维护自己的权益。可以咨询专业律师或法律援助机构，了解具体的法律程序和维权策略。
申请劳动仲裁或诉讼：在必要时，员工可以向劳动仲裁机构申请仲裁或向人民法院提起诉讼。在申请仲裁或诉讼前，员工应准备好相关证据材料，并详细陈述自己的诉求和理由。
综上所述，面对公司资质不全的问题，员工应保持冷静并理性应对。通过了解法律后果、保障自身权益以及采取具体措施来维护自己的合法权益。同时，员工也应积极与公司沟通协作，共同寻求解决方案以应对公司资质不全带来的挑战。