预付款过了三年被判不成立，再起诉对方不当得利有可能会过诉讼时效。具体分析如下：

首先，我们需要明确的是，不当得利之诉是受制于诉讼时效的。根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。这意味着，如果自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起三年内没有提起诉讼，那么权利人就可能丧失通过诉讼来保护自己权益的权利。

针对您的情况，预付款过了三年被判不成立，如果您想以不当得利为由再次起诉对方，那么就需要考虑是否已经超过了诉讼时效。如果自您知道或者应当知道对方不当得利之日起已经超过了三年，那么您再次提起诉讼就有可能会面临败诉的风险，因为对方可能会以诉讼时效已过为由进行抗辩。

当然，也有一些特殊情况可能会影响诉讼时效的计算，比如是否存在中断、中止或者延长诉讼时效的情形。这些都需要根据具体的案件事实和法律规定来进行判断。

因此，我建议您在决定再次起诉之前，先仔细回顾一下案件的事实和经过，确认一下是否已经超过了诉讼时效。如果确实存在超过诉讼时效的风险，那么您可能需要考虑通过其他途径来维护自己的权益，比如与对方进行协商或者寻求其他法律救济途径。如果您需要更具体的法律建议或者帮助，可以直接向我咨询。