结论：在劳动仲裁前公司已将厂房抵押，这并不影响你申请劳动仲裁，但可能会对后续仲裁裁决的执行产生一定影响。以下是具体分析和建议：

1. 劳动仲裁的申请与受理：

   • 劳动仲裁是解决劳动争议的一种法定方式，其受理并不受公司财产状况（如厂房是否抵押）的影响。
   • 你只需按照法定程序，向有管辖权的劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请书及相关证据材料，仲裁委员会在审查后会决定是否受理。

2. 抵押对仲裁裁决执行的影响：

   • 如果仲裁裁决支持了你的诉求（如要求公司支付工资、经济补偿等），而公司拒不履行，你可以向人民法院申请强制执行。
   • 然而，如果公司的厂房已经抵押给其他债权人，且该抵押权在仲裁裁决作出前已经设立并登记，那么在执行过程中，抵押权人可能享有优先受偿权。
   • 这意味着，在厂房的拍卖或变卖所得中，抵押权人将首先得到清偿，剩余部分才会用于清偿你的债权。

3. 应对策略与建议：

   • 及时申请仲裁：不要因为公司厂房已抵押而犹豫不决，及时申请仲裁是维护自身权益的关键。
   • 了解公司财产状况：在申请仲裁前，尽可能了解公司的财产状况，包括厂房的抵押情况、其他债权人的情况等，以便在仲裁和执行过程中更好地维护自己的权益。
   • 申请财产保全：如果担心公司在仲裁过程中转移或隐匿财产，你可以在仲裁过程中向仲裁委员会或人民法院申请财产保全，冻结公司的相关财产，确保仲裁裁决能够得到有效执行。
   • 关注抵押权实现情况：在执行过程中，密切关注抵押权的实现情况，如果抵押权已经实现且仍有剩余财产，及时向人民法院申请参与分配。

4. 法律程序与注意事项：

   • 在整个过程中，务必遵循法定程序，确保自己的行为合法合规。
   • 如果对法律程序不熟悉或遇到复杂情况，建议及时寻求专业法律帮助，以确保自己的权益得到充分保障。

总结：公司厂房的抵押情况并不影响你申请劳动仲裁的权利，但可能会对后续仲裁裁决的执行产生一定影响。因此，在申请仲裁前，你需要充分了解公司的财产状况，并在仲裁和执行过程中采取相应的策略来维护自己的权益。如果你在这个过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。